<div dir="ltr">Hi all,<div><br></div>I'm trying to get yt parallelism enabled to run on the visualization cluster at OLCF. I am using a conda environment for the yt prerequisites but I have the development branch of yt installed from source. To get the parallelism working I tried installing mpi4py both using pip and building it from source (with the latter, explicitly telling it that the MPI-enabled C compiler is the wrapper cc). However, the statement "from mpi4py import MPI" that yt uses to initialize the session fails with:<br><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><br>>>> from mpi4py import MPI<br>[Sun Jul 17 03:52:10 2016] [unknown] Fatal error in PMPI_Init_thread: Other MPI error, error stack:<br>MPIR_Init_thread(547):<br> MPID_Init(203).......: channel initialization failed<br>MPID_Init(584).......:  PMI2 init failed: 1<br> Aborted</blockquote><br>Some googling suggests that this is potentially an issue specific to the way Cray sets up their MPI installation. At any rate, although this is not necessarily a yt-specific issue, if anyone has relevant experience or knows a workaround, please let me know, thanks!<div><div><font color="#000000" face="Consolas, Lucida Console, monospace"><span style="font-size:12.8px"><br clear="all"></span></font><div><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">Max Katz<br>Ph.D. Candidate, Department of Physics and Astronomy<br>Stony Brook University<br><a href="http://astro.sunysb.edu/mkatz/" target="_blank">http://astro.sunysb.edu/mkatz/</a></div></div></div></div></div></div></div>
</div></div></div>