<div dir="ltr"><div>Hi all,</div><div><br></div><div>I am having trouble installing/running the latest yt on Xsede Smic and Comet clusters. I used to have yt3 on both machines and they were working fine. Recently, after failing to update yt, I decided to delete the old one and install the latest version. I am using the unmodified file from <a href="http://bitbucket.org/yt_analysis/yt/raw/yt/doc/install_script.sh">http://bitbucket.org/yt_analysis/yt/raw/yt/doc/install_script.sh</a></div><div><br></div><div><br></div><div>Here are the problems I have:</div><div><b>On Smic</b></div><div>When I do "yt update" on the login node, or when I try to submit a yt job, I get this error message</div><div>...</div>ValueError: numpy.dtype has the wrong size, try recompiling<br><div><br></div><div>I have seen this error message before and fixed it somehow, but I do not remember how...</div><div><br></div><div><br></div><div><b>On Comet</b></div><div>When I do "yt update", I get this error message:</div><div>...</div><div><div>YT site-packages not in path, so you must</div><div>update this installation manually by committing and</div><div>merging your modifications to the code before</div><div>updating to the newest changeset.</div></div><div><br></div><div>I manually set YT_DEST in my bash_profile, but that does not seem to help. I can however submit a yt job and it will run fine, but not in parallel. Before I reinstalled yt, I was able to run yt3 in parallel on Comet after loading mpi4py.<br></div><div><br></div><div><div>Also, when I do</div><div>"source ~/source/yt-conda/bin/activate" I get this error message:</div><div>Error: no environment provided.</div></div><div>and it seems that I do not even need to activate yt anymore (is it because I have "export PATH=/home/yuanli/source/yt-conda/bin:$PATH" in my bash_profile?). Maybe I missed something in the doc. I am very confused. </div><div><br></div><div><br></div><div>Thanks in advance!</div><div>Yuan</div></div>