<div dir="ltr">thanks very much everyone. solves my problem.</div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Sun, Feb 7, 2016 at 11:15 AM, Kacper Kowalik <span dir="ltr"><<a href="mailto:xarthisius.kk@gmail.com" target="_blank">xarthisius.kk@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><span class="">On 02/06/2016 09:03 PM, tazkera haque wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Hi , thanks very much for the helps. but I happen to get the errors still<br>
though I did the exact same things as suggested. I am attaching the summary<br>
and error.<br>
</blockquote>
<br></span>
Hi Tazkera,<br>
<br>
clean.sh unfortunately doesn't remove cythonized modules (.c files). You can either manually remove the offending file (yt/geometry/grid_container.c) or use hg purge. In order to do the latter you'll need to add the following to $HOME/.hgrc:<br>
<br>
[extensions]<br>
hgext.purge =<br>
<br>
Then try:<br>
<br>
$ cd /work/03858/thaque56/sw/yt-3.1/yt-x86_64/src/yt-hg/<br>
$ hg purge --all<br>
$ python setup.py build_ext -i  # (or python setup.py develop)<br>
<br>
Cheers,<br>
Kacper<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
On Sat, Feb 6, 2016 at 9:05 PM, Nathan Goldbaum <<a href="mailto:nathan12343@gmail.com" target="_blank">nathan12343@gmail.com</a>><br>
wrote:<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
It looks like yt's C extensions need to be recompiled. Can you activate<br>
the yt environment and do the following:<br>
<br>
$ cd /work/03858/thaque56/sw/yt-3.1/yt-x86_64/src/yt-hg/<br>
$ bash ./clean.sh<br>
$ hg pull<br>
$ hg update<br>
$ python setup.py develop<br>
<br>
If that doesn't work, can you reply with the output of "hg summary", as<br>
well as the error that you see?<br>
<br>
Hope that helps,<br>
<br>
Nathan<br>
<br>
On Sat, Feb 6, 2016 at 7:25 PM, tazkera haque <<a href="mailto:h.tazkera@gmail.com" target="_blank">h.tazkera@gmail.com</a>> wrote:<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Hi , I am trying to run a python file with yt packages on STAMPEDE. and<br>
getting some errors each time. I think the error is due to some<br>
installation error of yt at first place. can you please look at both my<br>
code and error and send me the solutions to solve the problem. both the<br>
files are attached for your convenience.<br>
<br>
regards<br>
Tazkera<br>
<br>
_______________________________________________<br>
yt-users mailing list<br>
<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org" target="_blank">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
<br>
<br>
</blockquote>
<br>
_______________________________________________<br>
yt-users mailing list<br>
<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org" target="_blank">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
<br>
<br>
</blockquote>
<br>
<br>
<br>
_______________________________________________<br>
yt-users mailing list<br>
<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org" target="_blank">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
<br>
</blockquote>
<br>
_______________________________________________<br>
yt-users mailing list<br>
<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org" target="_blank">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
</div></div></blockquote></div><br></div>