<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8"><div dir="ltr"><div><div><div><div><div>Dear yt:<br><br></div><div>Thank you Matthew Turk for helping with my script.<br></div><br>My original code is written in fortran. I think your code the fields are reshaped as per C. My original code output was of the form 1 column  (x1,x2,x3,.....,y1,y2,y3,......z1,z2,z3), which need to be reshaped to <br></div>(x1,y1,z1)<br>.<br>.<br>.<br></div>(xn,yn,zn)<br><br></div>How do I reshape the fields to to get desired output?<br><br></div>Thank you in advance<br><div><div><br><div><div><div><div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, Jan 14, 2016 at 2:01 PM,  <span dir="ltr"><<a href="mailto:yt-users-request@lists.spacepope.org" target="_blank">yt-users-request@lists.spacepope.org</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Send yt-users mailing list submissions to<br>
        <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
<br>
To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit<br>
        <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lists.spacepope.org_listinfo.cgi_yt-2Dusers-2Dspacepope.org&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=AzQNn1-DSkRQT72NQ7392PQzULhDse4Ct4JD3xqnfek&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
or, via email, send a message with subject or body 'help' to<br>
        <a href="mailto:yt-users-request@lists.spacepope.org">yt-users-request@lists.spacepope.org</a><br>
<br>
You can reach the person managing the list at<br>
        <a href="mailto:yt-users-owner@lists.spacepope.org">yt-users-owner@lists.spacepope.org</a><br>
<br>
When replying, please edit your Subject line so it is more specific<br>
than "Re: Contents of yt-users digest..."<br>
<br>
<br>
Today's Topics:<br>
<br>
   1. Re: Error while using SlicePlot (Matthew Turk)<br>
<br>
<br>
----------------------------------------------------------------------<br>
<br>
Message: 1<br>
Date: Thu, 14 Jan 2016 14:01:37 -0600<br>
From: Matthew Turk <<a href="mailto:matthewturk@gmail.com">matthewturk@gmail.com</a>><br>
To: Discussion of the yt analysis package<br>
        <<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a>><br>
Subject: Re: [yt-users] Error while using SlicePlot<br>
Message-ID:<br>
        <CALO3=<a href="mailto:5GMCcT_YiqYsp5jT6Ot252fqEeSgLAMdzB7CuPaw-nKZg@mail.gmail.com">5GMCcT_YiqYsp5jT6Ot252fqEeSgLAMdzB7CuPaw-nKZg@mail.gmail.com</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset=UTF-8<br>
<br>
Hi Sushil,<br>
<br>
I've looked at your data and script, and I think I see what's going<br>
on, but I need your help figuring out where to go from here.  It looks<br>
to me like you have 1536 values, which correspond to 3 values for each<br>
cell in an 8x8x8 grid.  I've rewritten your script slightly but don't<br>
know if I've done it correctly.  This makes a dataset with 3 fields<br>
(field1, field2, field3 as I've called them) that is 8x8x8, and it<br>
slices them.<br>
<br>
Can you tell me if I am interpreting this correctly?  Here is my<br>
modified version of the script:<br>
<br>
<a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__paste.yt-2Dproject.org_show_6144_&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=HquulXESrwRkuHaKSG9yTnglY3Aq2JZDdxVIztuUDOo&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://paste.yt-project.org/show/6144/</a><br>
<br>
On Thu, Jan 14, 2016 at 11:08 AM, Sushilkumar <<a href="mailto:sushil.sush19us@gmail.com">sushil.sush19us@gmail.com</a>> wrote:<br>
> Dear yt:<br>
><br>
> I was able to match my input data with the domain_dimension but still I am<br>
> getting an error as below. The link to files are below. Wherein Expl_B_n.mtx<br>
> is the original file whereas split1.txt is the file that matches<br>
> domain_dimension.<br>
><br>
><br>
> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=https-3A__drive.google.com_open-3Fid-3D0B4g8shg4DL7oak5PLWVVdG5UMHc&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=EAA9VP6eoU8o57692xbS58-iWwTunQi7l__b5LJGl9Q&e=" rel="noreferrer" target="_blank">https://drive.google.com/open?id=0B4g8shg4DL7oak5PLWVVdG5UMHc</a><br>
><br>
><br>
> Error:-<br>
> Traceback (most recent call last):<br>
>   File "numpy_loadtxt.py", line 31, in <module><br>
>     slc = yt.SlicePlot(pf, 2, ["Density"])<br>
>   File<br>
> "/state/partition1/anaconda/lib/python2.7/site-packages/yt/visualization/plot_window.py",<br>
> line 2133, in SlicePlot<br>
>     return AxisAlignedSlicePlot(ds, normal, fields, *args, **kwargs)<br>
>   File<br>
> "/state/partition1/anaconda/lib/python2.7/site-packages/yt/visualization/plot_window.py",<br>
> line 1274, in __init__<br>
>     window_size=window_size, aspect=aspect)<br>
>   File<br>
> "/state/partition1/anaconda/lib/python2.7/site-packages/yt/visualization/plot_window.py",<br>
> line 669, in __init__<br>
>     PlotWindow.__init__(self, *args, **kwargs)<br>
>   File<br>
> "/state/partition1/anaconda/lib/python2.7/site-packages/yt/visualization/plot_window.py",<br>
> line 249, in __init__<br>
>     self._setup_plots()<br>
>   File<br>
> "/state/partition1/anaconda/lib/python2.7/site-packages/yt/visualization/plot_window.py",<br>
> line 769, in _setup_plots<br>
>     image = self.frb[f]<br>
>   File<br>
> "/state/partition1/anaconda/lib/python2.7/site-packages/yt/visualization/fixed_resolution.py",<br>
> line 137, in __getitem__<br>
>     int(self.antialias))<br>
>   File<br>
> "/state/partition1/anaconda/lib/python2.7/site-packages/yt/geometry/coordinates/cartesian_coordinates.py",<br>
> line 57, in pixelize<br>
>     antialias, dimension, periodic)<br>
>   File<br>
> "/state/partition1/anaconda/lib/python2.7/site-packages/yt/geometry/coordinates/cartesian_coordinates.py",<br>
> line 74, in _ortho_pixelize<br>
>     period, int(periodic)).transpose()<br>
> _MPL.error: data is of incorrect type (wanted 1D float)<br>
><br>
><br>
> Thank you in advance<br>
><br>
><br>
><br>
><br>
> On Tue, Jan 12, 2016 at 10:04 AM, <<a href="mailto:yt-users-request@lists.spacepope.org">yt-users-request@lists.spacepope.org</a>><br>
> wrote:<br>
>><br>
>> Send yt-users mailing list submissions to<br>
>>         <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
>><br>
>> To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit<br>
>>         <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lists.spacepope.org_listinfo.cgi_yt-2Dusers-2Dspacepope.org&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=AzQNn1-DSkRQT72NQ7392PQzULhDse4Ct4JD3xqnfek&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
>> or, via email, send a message with subject or body 'help' to<br>
>>         <a href="mailto:yt-users-request@lists.spacepope.org">yt-users-request@lists.spacepope.org</a><br>
>><br>
>> You can reach the person managing the list at<br>
>>         <a href="mailto:yt-users-owner@lists.spacepope.org">yt-users-owner@lists.spacepope.org</a><br>
>><br>
>> When replying, please edit your Subject line so it is more specific<br>
>> than "Re: Contents of yt-users digest..."<br>
>><br>
>><br>
>> Today's Topics:<br>
>><br>
>>    1. Re: Error while using SlicePlot (Nathan Goldbaum)<br>
>><br>
>><br>
>> ----------------------------------------------------------------------<br>
>><br>
>> Message: 1<br>
>> Date: Tue, 12 Jan 2016 10:03:41 -0600<br>
>> From: Nathan Goldbaum <<a href="mailto:nathan12343@gmail.com">nathan12343@gmail.com</a>><br>
>> To: Discussion of the yt analysis package<br>
>>         <<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a>><br>
>> Subject: Re: [yt-users] Error while using SlicePlot<br>
>> Message-ID:<br>
>><br>
>> <<a href="mailto:CAJXewOn9qs7TQ7EPaOee3H6wscm1U5acei-_%2BvBCQ3SaATQi7g@mail.gmail.com">CAJXewOn9qs7TQ7EPaOee3H6wscm1U5acei-_+vBCQ3SaATQi7g@mail.gmail.com</a>><br>
>> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"<br>
>><br>
>> Hi,<br>
>><br>
>> The dimensions of your "vector" array need to match the domain_dimensions<br>
>> you pass to load_uniform_grid. I was able to fake this by<br>
>> load_uniform_grid<br>
>> the "arr" array of random numbers you generate in your script rather than<br>
>> the data loaded in from the text file.<br>
>><br>
>> I'm not sure what the 1D vector in your u25.mtx file actually means, so I<br>
>> have no idea what the "correct" thing to do here is, but you'll to pass in<br>
>> data that has the same shape as the domain_dimensions you specify.<br>
>><br>
>> Admittedly, the error message you received was not very nice, so I've<br>
>> opened a pull request to validate that the shapes of data passed to<br>
>> load_uniform_grid are correct, and throw an error message if they are not.<br>
>><br>
>> Here is a sample script based on yours that runs without erroring out:<br>
>><br>
>> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__paste.yt-2Dproject.org_show_6140_&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=m-zEoMojoJWG02pQeMxxDY2b3qxhd5ybUChh6dUU9tc&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://paste.yt-project.org/show/6140/</a><br>
>><br>
>> Hope that helps,<br>
>><br>
>> Nathan<br>
>><br>
>><br>
>> On Mon, Jan 11, 2016 at 4:41 PM, Sushilkumar <<a href="mailto:sushil.sush19us@gmail.com">sushil.sush19us@gmail.com</a>><br>
>> wrote:<br>
>><br>
>> > Hi yt:<br>
>> ><br>
>> > Link to the Google drive is below. It has python script numpy_loadtxt.py<br>
>> > and data set u25.mtx.<br>
>> ><br>
>> ><br>
>> ><br>
>> ><br>
>> > <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=https-3A__drive.google.com_folderview-3Fid-3D0B4g8shg4DL7oak5PLWVVdG5UMHc-26usp-3Dsharing&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=iMvA_KsS47lZv_LAUDRWd1cetGcO7xL8D_uo5lQMx-s&e=" rel="noreferrer" target="_blank">https://drive.google.com/folderview?id=0B4g8shg4DL7oak5PLWVVdG5UMHc&usp=sharing</a><br>
>> ><br>
>> > On Mon, Jan 11, 2016 at 4:27 PM, <<a href="mailto:yt-users-request@lists.spacepope.org">yt-users-request@lists.spacepope.org</a>><br>
>> > wrote:<br>
>> ><br>
>> >> Send yt-users mailing list submissions to<br>
>> >>         <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
>> >><br>
>> >> To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit<br>
>> >>         <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lists.spacepope.org_listinfo.cgi_yt-2Dusers-2Dspacepope.org&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=AzQNn1-DSkRQT72NQ7392PQzULhDse4Ct4JD3xqnfek&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
>> >> or, via email, send a message with subject or body 'help' to<br>
>> >>         <a href="mailto:yt-users-request@lists.spacepope.org">yt-users-request@lists.spacepope.org</a><br>
>> >><br>
>> >> You can reach the person managing the list at<br>
>> >>         <a href="mailto:yt-users-owner@lists.spacepope.org">yt-users-owner@lists.spacepope.org</a><br>
>> >><br>
>> >> When replying, please edit your Subject line so it is more specific<br>
>> >> than "Re: Contents of yt-users digest..."<br>
>> >><br>
>> >><br>
>> >> Today's Topics:<br>
>> >><br>
>> >>    1. Re: Error while using SlicePlot (Nathan Goldbaum)<br>
>> >><br>
>> >><br>
>> >> ----------------------------------------------------------------------<br>
>> >><br>
>> >> Message: 1<br>
>> >> Date: Mon, 11 Jan 2016 16:27:17 -0600<br>
>> >> From: Nathan Goldbaum <<a href="mailto:nathan12343@gmail.com">nathan12343@gmail.com</a>><br>
>> >> To: Discussion of the yt analysis package<br>
>> >>         <<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a>><br>
>> >> Subject: Re: [yt-users] Error while using SlicePlot<br>
>> >> Message-ID:<br>
>> >>         <CAJXewOkjMD3CCPbi6gseJK0Q2r2cHXews2EDm-cd=<br>
>> >> <a href="mailto:LZdbzcHZg@mail.gmail.com">LZdbzcHZg@mail.gmail.com</a>><br>
>> >> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"<br>
>> >><br>
>> >> Hi Sushilkumar,<br>
>> >><br>
>> >> Is there any chance you can share your full script, along with a sample<br>
>> >> dataset that triggers the error? You can share the dataset using e.g.<br>
>> >> dropbox or google drive.<br>
>> >><br>
>> >> Thanks!<br>
>> >><br>
>> >> -Nathan<br>
>> >><br>
>> >> On Mon, Jan 11, 2016 at 4:25 PM, Sushilkumar<br>
>> >> <<a href="mailto:sushil.sush19us@gmail.com">sushil.sush19us@gmail.com</a>><br>
>> >> wrote:<br>
>> >><br>
>> >> > Dear yt:<br>
>> >> ><br>
>> >> > Could you help me with the error below? It arises after using<br>
>> >> > SlicePlot<br>
>> >> > after formatting the data to numpy array from a file<br>
>> >> ><br>
>> >> ><br>
>> >> > Traceback (most recent call last):<br>
>> >> >   File "numpy_loadtxt.py", line 20, in <module><br>
>> >> >     slc = SlicePlot(pf, 2, ["Density"])<br>
>> >> >   File<br>
>> >> ><br>
>> >><br>
>> >> "/state/partition1/anaconda/lib/python2.7/site-packages/yt/visualization/plot_window.py",<br>
>> >> > line 2133, in SlicePlot<br>
>> >> >     return AxisAlignedSlicePlot(ds, normal, fields, *args, **kwargs)<br>
>> >> >   File<br>
>> >> ><br>
>> >><br>
>> >> "/state/partition1/anaconda/lib/python2.7/site-packages/yt/visualization/plot_window.py",<br>
>> >> > line 1274, in __init__<br>
>> >> >     window_size=window_size, aspect=aspect)<br>
>> >> >   File<br>
>> >> ><br>
>> >><br>
>> >> "/state/partition1/anaconda/lib/python2.7/site-packages/yt/visualization/plot_window.py",<br>
>> >> > line 669, in __init__<br>
>> >> >     PlotWindow.__init__(self, *args, **kwargs)<br>
>> >> >   File<br>
>> >> ><br>
>> >><br>
>> >> "/state/partition1/anaconda/lib/python2.7/site-packages/yt/visualization/plot_window.py",<br>
>> >> > line 249, in __init__<br>
>> >> >     self._setup_plots()<br>
>> >> >   File<br>
>> >> ><br>
>> >><br>
>> >> "/state/partition1/anaconda/lib/python2.7/site-packages/yt/visualization/plot_window.py",<br>
>> >> > line 769, in _setup_plots<br>
>> >> >     image = self.frb[f]<br>
>> >> >   File<br>
>> >> ><br>
>> >><br>
>> >> "/state/partition1/anaconda/lib/python2.7/site-packages/yt/visualization/fixed_resolution.py",<br>
>> >> > line 137, in __getitem__<br>
>> >> >     int(self.antialias))<br>
>> >> >   File<br>
>> >> ><br>
>> >><br>
>> >> "/state/partition1/anaconda/lib/python2.7/site-packages/yt/geometry/coordinates/cartesian_coordinates.py",<br>
>> >> > line 57, in pixelize<br>
>> >> >     antialias, dimension, periodic)<br>
>> >> >   File<br>
>> >> ><br>
>> >><br>
>> >> "/state/partition1/anaconda/lib/python2.7/site-packages/yt/geometry/coordinates/cartesian_coordinates.py",<br>
>> >> > line 74, in _ortho_pixelize<br>
>> >> >     period, int(periodic)).transpose()<br>
>> >> > _MPL.error: data is of incorrect type (wanted 1D float)<br>
>> >> ><br>
>> >> ><br>
>> >> ><br>
>> >> > On Mon, Jan 4, 2016 at 11:10 AM,<br>
>> >> > <<a href="mailto:yt-users-request@lists.spacepope.org">yt-users-request@lists.spacepope.org</a>><br>
>> >> > wrote:<br>
>> >> ><br>
>> >> >> Send yt-users mailing list submissions to<br>
>> >> >>         <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
>> >> >><br>
>> >> >> To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit<br>
>> >> >><br>
>> >> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lists.spacepope.org_listinfo.cgi_yt-2Dusers-2Dspacepope.org&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=AzQNn1-DSkRQT72NQ7392PQzULhDse4Ct4JD3xqnfek&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
>> >> >> or, via email, send a message with subject or body 'help' to<br>
>> >> >>         <a href="mailto:yt-users-request@lists.spacepope.org">yt-users-request@lists.spacepope.org</a><br>
>> >> >><br>
>> >> >> You can reach the person managing the list at<br>
>> >> >>         <a href="mailto:yt-users-owner@lists.spacepope.org">yt-users-owner@lists.spacepope.org</a><br>
>> >> >><br>
>> >> >> When replying, please edit your Subject line so it is more specific<br>
>> >> >> than "Re: Contents of yt-users digest..."<br>
>> >> >><br>
>> >> >><br>
>> >> >> Today's Topics:<br>
>> >> >><br>
>> >> >>    1. Re: Issue with loading data (John ZuHone)<br>
>> >> >><br>
>> >> >><br>
>> >> >><br>
>> >> >> ----------------------------------------------------------------------<br>
>> >> >><br>
>> >> >> Message: 1<br>
>> >> >> Date: Mon, 4 Jan 2016 12:10:11 -0500<br>
>> >> >> From: John ZuHone <<a href="mailto:jzuhone@gmail.com">jzuhone@gmail.com</a>><br>
>> >> >> To: Discussion of the yt analysis package<br>
>> >> >>         <<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a>><br>
>> >> >> Subject: Re: [yt-users] Issue with loading data<br>
>> >> >> Message-ID: <<a href="mailto:BF0E1EAF-D72D-483C-98FC-3C08C9968667@gmail.com">BF0E1EAF-D72D-483C-98FC-3C08C9968667@gmail.com</a>><br>
>> >> >> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"<br>
>> >> >><br>
>> >> >> yt.loadtxt only works in the current development version of the 3.x<br>
>> >> >> series of yt.<br>
>> >> >><br>
>> >> >> John ZuHone<br>
>> >> >> Harvard-Smithsonian Center for Astrophysics<br>
>> >> >><br>
>> >> >> 60 Garden St., MS-67<br>
>> >> >> Cambridge, MA 02138<br>
>> >> >> (w) <a href="tel:617-496-1816" value="+16174961816">617-496-1816</a><br>
>> >> >> (m) <a href="tel:781-708-5004" value="+17817085004">781-708-5004</a><br>
>> >> >> <a href="mailto:jzuhone@cfa.harvard.edu">jzuhone@cfa.harvard.edu</a><br>
>> >> >> <a href="mailto:jzuhone@gmail.com">jzuhone@gmail.com</a><br>
>> >> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__www.jzuhone.com&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=Fxn-BBcR8BaoM7Usw8IZPoSZrvqmTnkJiIk8c1xnHfg&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.jzuhone.com</a><br>
>> >> >><br>
>> >> >> > On Jan 4, 2016, at 12:06 PM, Sushilkumar<br>
>> >> >> > <<a href="mailto:sushil.sush19us@gmail.com">sushil.sush19us@gmail.com</a>><br>
>> >> >> wrote:<br>
>> >> >> ><br>
>> >> >> > Dear yt:<br>
>> >> >> ><br>
>> >> >> > Can I use yt.loadtxt for yt version 2.6.1?<br>
>> >> >> > Are there examples for "loading from file" using numpy array? The<br>
>> >> link<br>
>> >> >> below formats as numpy array but not from file.<br>
>> >> >> ><br>
>> >> >> ><br>
>> >> >><br>
>> >><br>
>> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__yt-2Dproject.org_docs_2.6_examining_generic-5Farray-5Fdata.html-3Fhighlight-3Dload-5Funiform-5Fgrid&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=Z7yPnhl_37ORa8HO0bIQORL6ig-42AnY2TN7ys9bcNM&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://yt-project.org/docs/2.6/examining/generic_array_data.html?highlight=load_uniform_grid</a><br>
>> >> >> ><br>
>> >> >> ><br>
>> >> >> ><br>
>> >> >> >> On Mon, Jan 4, 2016 at 10:52 AM, <<br>
>> >> <a href="mailto:yt-users-request@lists.spacepope.org">yt-users-request@lists.spacepope.org</a>><br>
>> >> >> wrote:<br>
>> >> >> >> Send yt-users mailing list submissions to<br>
>> >> >> >>         <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
>> >> >> >><br>
>> >> >> >> To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit<br>
>> >> >> >><br>
>> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lists.spacepope.org_listinfo.cgi_yt-2Dusers-2Dspacepope.org&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=AzQNn1-DSkRQT72NQ7392PQzULhDse4Ct4JD3xqnfek&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
>> >> >> >> or, via email, send a message with subject or body 'help' to<br>
>> >> >> >>         <a href="mailto:yt-users-request@lists.spacepope.org">yt-users-request@lists.spacepope.org</a><br>
>> >> >> >><br>
>> >> >> >> You can reach the person managing the list at<br>
>> >> >> >>         <a href="mailto:yt-users-owner@lists.spacepope.org">yt-users-owner@lists.spacepope.org</a><br>
>> >> >> >><br>
>> >> >> >> When replying, please edit your Subject line so it is more<br>
>> >> >> >> specific<br>
>> >> >> >> than "Re: Contents of yt-users digest..."<br>
>> >> >> >><br>
>> >> >> >><br>
>> >> >> >> Today's Topics:<br>
>> >> >> >><br>
>> >> >> >>    1. Re: problem with yt update to 3.0 (John ZuHone)<br>
>> >> >> >><br>
>> >> >> >><br>
>> >> >> >><br>
>> >> ----------------------------------------------------------------------<br>
>> >> >> >><br>
>> >> >> >> Message: 1<br>
>> >> >> >> Date: Mon, 4 Jan 2016 11:52:03 -0500<br>
>> >> >> >> From: John ZuHone <<a href="mailto:jzuhone@gmail.com">jzuhone@gmail.com</a>><br>
>> >> >> >> To: Discussion of the yt analysis package<br>
>> >> >> >>         <<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a>><br>
>> >> >> >> Subject: Re: [yt-users] problem with yt update to 3.0<br>
>> >> >> >> Message-ID: <<a href="mailto:E58E10EE-846A-4595-87EC-47CAF9CDA022@gmail.com">E58E10EE-846A-4595-87EC-47CAF9CDA022@gmail.com</a>><br>
>> >> >> >> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"<br>
>> >> >> >><br>
>> >> >> >> In the current development version of yt there is also<br>
>> >> >> >> yt.loadtxt,<br>
>> >> >> which is essentially a wrapper for numpy.loadtxt which also accepts<br>
>> >> unit<br>
>> >> >> information.<br>
>> >> >> >><br>
>> >> >> >> See<br>
>> >> >><br>
>> >><br>
>> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__yt-2Dproject.org_docs_dev_analyzing_units_symbolic-5Funits.html-23Saving-2Dand-2DLoading-2DYTArrays-2Dto_from-2Ddisk&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=AyDeWpwHglB3tPagpmbR70d3h9LloQ3mFp4qjk1bBf4&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://yt-project.org/docs/dev/analyzing/units/symbolic_units.html#Saving-and-Loading-YTArrays-to/from-disk</a><br>
>> >> >> <<br>
>> >> >><br>
>> >><br>
>> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__yt-2Dproject.org_docs_dev_analyzing_units_symbolic-5Funits.html-23Saving-2Dand-2DLoading-2DYTArrays-2Dto_from-2Ddisk&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=AyDeWpwHglB3tPagpmbR70d3h9LloQ3mFp4qjk1bBf4&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://yt-project.org/docs/dev/analyzing/units/symbolic_units.html#Saving-and-Loading-YTArrays-to/from-disk</a><br>
>> >> >> ><br>
>> >> >> >><br>
>> >> >> >> > On Dec 30, 2015, at 12:01 PM, Sushilkumar <<br>
>> >> <a href="mailto:sushil.sush19us@gmail.com">sushil.sush19us@gmail.com</a>><br>
>> >> >> wrote:<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > Dear Nathan:<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > As per your advice I am trying to load my text file to numpy<br>
>> >> array.<br>
>> >> >> But there are two ways to so using numpy.loadtxt and numpy.fromfile.<br>
>> >> Could<br>
>> >> >> you suggest which of them is more efficient for large files and more<br>
>> >> >> suitable for yt (if any)?<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > Thanks in advance<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > On Sat, Dec 26, 2015 at 6:43 PM, Sushilkumar Sreekumar <<br>
>> >> >> <a href="mailto:sushil.sush19us@gmail.com">sushil.sush19us@gmail.com</a> <mailto:<a href="mailto:sushil.sush19us@gmail.com">sushil.sush19us@gmail.com</a>>> wrote:<br>
>> >> >> >> > Dear Nathan:<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > Thank you for your help<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > --<br>
>> >> >> >> > SK2<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > "Claiming that something can move faster than light is a good<br>
>> >> >> conversation-stopper in physics. People edge away from you in<br>
>> >> >> cocktail<br>
>> >> >> parties; friends never return phone calls. You just don?t mess with<br>
>> >> Albert<br>
>> >> >> Einstein."<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > From: Nathan Goldbaum <mailto:<a href="mailto:nathan12343@gmail.com">nathan12343@gmail.com</a>><br>
>> >> >> >> > Sent: Saturday, December 26, 2015 12:34 PM<br>
>> >> >> >> > To: Sushilkumar <mailto:<a href="mailto:sushil.sush19us@gmail.com">sushil.sush19us@gmail.com</a>><br>
>> >> >> >> > Cc: Discussion of the yt analysis package <mailto:<br>
>> >> >> <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a>><br>
>> >> >> >> > Subject: Re: [yt-users] problem with yt update to 3.0<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > If you can format your data as numpy arrays, there are examples<br>
>> >> >> >> > of<br>
>> >> >> how to load your data into yt here:<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >><br>
>> >><br>
>> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__yt-2Dproject.org_docs_2.6_examining_generic-5Farray-5Fdata.html-3Fhighlight-3Dload-5Funiform-5Fgrid&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=Z7yPnhl_37ORa8HO0bIQORL6ig-42AnY2TN7ys9bcNM&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://yt-project.org/docs/2.6/examining/generic_array_data.html?highlight=load_uniform_grid</a><br>
>> >> >> <<br>
>> >> >><br>
>> >><br>
>> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__yt-2Dproject.org_docs_2.6_examining_generic-5Farray-5Fdata.html-3Fhighlight-3Dload-5Funiform-5Fgrid&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=Z7yPnhl_37ORa8HO0bIQORL6ig-42AnY2TN7ys9bcNM&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://yt-project.org/docs/2.6/examining/generic_array_data.html?highlight=load_uniform_grid</a><br>
>> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > yt (2.6.1 or newer) does not support i/o from arbitrary text<br>
>> >> files.<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > On Sat, Dec 26, 2015 at 12:30 PM, Sushilkumar <<br>
>> >> >> <a href="mailto:sushil.sush19us@gmail.com">sushil.sush19us@gmail.com</a> <mailto:<a href="mailto:sushil.sush19us@gmail.com">sushil.sush19us@gmail.com</a>>> wrote:<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > Dear Nathan:<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > I will try it and let you know. In the meanwhile, could you let<br>
>> >> >> >> > me<br>
>> >> >> know if yt supports loading text file for version 2.6.1? If so could<br>
>> >> you<br>
>> >> >> point me to examples for the same.<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > Thanks in advance<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > On Sat, Dec 26, 2015, 11:44 Nathan Goldbaum <<br>
>> >> <a href="mailto:nathan12343@gmail.com">nathan12343@gmail.com</a><br>
>> >> >> <mailto:<a href="mailto:nathan12343@gmail.com">nathan12343@gmail.com</a>>> wrote:<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > This is happening because python is unable to link against an<br>
>> >> >> openSSL library.<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > Can you try using the get_yt.sh script install of the<br>
>> >> >> install_script.sh script:<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >><br>
>> >><br>
>> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=https-3A__bitbucket.org_yt-5Fanalysis_yt_raw_d9502d84802972ba3e644d2d5c47b87f73a6bd08_doc_get-5Fyt.sh&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=cVGT12J5YdOoi--Q2IuSp-Fp956Y6dQUcIL8Tl8JbZw&e=" rel="noreferrer" target="_blank">https://bitbucket.org/yt_analysis/yt/raw/d9502d84802972ba3e644d2d5c47b87f73a6bd08/doc/get_yt.sh</a><br>
>> >> >> <<br>
>> >> >><br>
>> >><br>
>> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=https-3A__bitbucket.org_yt-5Fanalysis_yt_raw_d9502d84802972ba3e644d2d5c47b87f73a6bd08_doc_get-5Fyt.sh&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=cVGT12J5YdOoi--Q2IuSp-Fp956Y6dQUcIL8Tl8JbZw&e=" rel="noreferrer" target="_blank">https://bitbucket.org/yt_analysis/yt/raw/d9502d84802972ba3e644d2d5c47b87f73a6bd08/doc/get_yt.sh</a><br>
>> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > This script installs yt using the miniconda python<br>
>> >> >> >> > distribution,<br>
>> >> >> which includes a precompiled python and openSSL library.<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > -Nathan<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > On Sat, Dec 26, 2015 at 11:40 AM, Sushilkumar <<br>
>> >> >> <a href="mailto:sushil.sush19us@gmail.com">sushil.sush19us@gmail.com</a> <mailto:<a href="mailto:sushil.sush19us@gmail.com">sushil.sush19us@gmail.com</a>>> wrote:<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > Hi Nathan:<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > Thanks for your reply.<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > I had  done that before installing version 2.X. I used to get<br>
>> >> errors<br>
>> >> >> as below. Even now I keep getting the same error after reinstalling<br>
>> >> from<br>
>> >> >> scratch. The error comes after "installing pip". I tried it on my pc<br>
>> >> and<br>
>> >> >> also on cluster but same issues.<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > ********************************************<br>
>> >> >> >> >         FAILURE REPORT:<br>
>> >> >> >> > ********************************************<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> >     bootstrap(tmpdir=tmpdir)<br>
>> >> >> >> >   File "get-pip.py", line 82, in bootstrap<br>
>> >> >> >> >     import pip<br>
>> >> >> >> >   File "/tmp/tmpxKqAjR/pip.zip/pip/__init__.py", line 15, in<br>
>> >> <module><br>
>> >> >> >> >   File "/tmp/tmpxKqAjR/pip.zip/pip/vcs/subversion.py", line 9,<br>
>> >> >> >> > in<br>
>> >> >> <module><br>
>> >> >> >> >   File "/tmp/tmpxKqAjR/pip.zip/pip/index.py", line 30, in<br>
>> >> >> >> > <module><br>
>> >> >> >> >   File "/tmp/tmpxKqAjR/pip.zip/pip/wheel.py", line 35, in<br>
>> >> >> >> > <module><br>
>> >> >> >> >   File "/tmp/tmpxKqAjR/pip.zip/pip/_vendor/distlib/scripts.py",<br>
>> >> line<br>
>> >> >> 14, in <module><br>
>> >> >> >> >   File "/tmp/tmpxKqAjR/pip.zip/pip/_vendor/distlib/compat.py",<br>
>> >> line<br>
>> >> >> 31, in <module><br>
>> >> >> >> > ImportError: cannot import name HTTPSHandler<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > ********************************************<br>
>> >> >> >> > ********************************************<br>
>> >> >> >> > Failure.  Check /home/adrith/yt-x86_64/yt_install.log.  The<br>
>> >> >> >> > last<br>
>> >> 10<br>
>> >> >> lines are above.<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > On Sat, Dec 26, 2015 at 10:41 AM, Nathan Goldbaum <<br>
>> >> >> <a href="mailto:nathan12343@gmail.com">nathan12343@gmail.com</a> <mailto:<a href="mailto:nathan12343@gmail.com">nathan12343@gmail.com</a>>> wrote:<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > Hi Sushilkumar,<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > Can you try reinstalling yt from scratch?<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > -Nathan<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > On Sat, Dec 26, 2015 at 10:39 AM, Sushilkumar <<br>
>> >> >> <a href="mailto:sushil.sush19us@gmail.com">sushil.sush19us@gmail.com</a> <mailto:<a href="mailto:sushil.sush19us@gmail.com">sushil.sush19us@gmail.com</a>>> wrote:<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > Dear yt:<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > I am currently running yt version 2.6.1 and want to update to<br>
>> >> >> version 3 (to read text files). Could you provide me link to so?<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > I tried it using yt update --all as per the link<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >><br>
>> >><br>
>> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__yt-2Dproject.org_doc_yt3differences.html-23updating-2Dto-2Dyt-2D3-2D0-2Dfrom-2Dold-2Dversions-2Dand-2Dgoing-2Dback&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=hfoahXmvDkCQupHGMOK5hOz9kOtXW6xfWQRkabzvmw0&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://yt-project.org/doc/yt3differences.html#updating-to-yt-3-0-from-old-versions-and-going-back</a><br>
>> >> >> <<br>
>> >> >><br>
>> >><br>
>> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__yt-2Dproject.org_doc_yt3differences.html-23updating-2Dto-2Dyt-2D3-2D0-2Dfrom-2Dold-2Dversions-2Dand-2Dgoing-2Dback&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=hfoahXmvDkCQupHGMOK5hOz9kOtXW6xfWQRkabzvmw0&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://yt-project.org/doc/yt3differences.html#updating-to-yt-3-0-from-old-versions-and-going-back</a><br>
>> >> >> ><br>
>> >> >> >> > .<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > But it wont update to 3.0 and still shows as 2.6.1<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > Kindly help<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > Thanks in advance<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > sushilkumar<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > On Thu, Dec 24, 2015 at 12:25 PM, <<br>
>> >> >> <a href="mailto:yt-users-request@lists.spacepope.org">yt-users-request@lists.spacepope.org</a> <mailto:<br>
>> >> >> <a href="mailto:yt-users-request@lists.spacepope.org">yt-users-request@lists.spacepope.org</a>>> wrote:<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > Send yt-users mailing list submissions to<br>
>> >> >> >> >         <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a> <mailto:<br>
>> >> >> <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a>><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lists.spacepope.org_listinfo.cgi_yt-2Dusers-2Dspacepope.org&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=AzQNn1-DSkRQT72NQ7392PQzULhDse4Ct4JD3xqnfek&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a> <<br>
>> >> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lists.spacepope.org_listinfo.cgi_yt-2Dusers-2Dspacepope.org&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=AzQNn1-DSkRQT72NQ7392PQzULhDse4Ct4JD3xqnfek&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a>><br>
>> >> >> >> > or, via email, send a message with subject or body 'help' to<br>
>> >> >> >> >         <a href="mailto:yt-users-request@lists.spacepope.org">yt-users-request@lists.spacepope.org</a> <mailto:<br>
>> >> >> <a href="mailto:yt-users-request@lists.spacepope.org">yt-users-request@lists.spacepope.org</a>><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > You can reach the person managing the list at<br>
>> >> >> >> >         <a href="mailto:yt-users-owner@lists.spacepope.org">yt-users-owner@lists.spacepope.org</a> <mailto:<br>
>> >> >> <a href="mailto:yt-users-owner@lists.spacepope.org">yt-users-owner@lists.spacepope.org</a>><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > When replying, please edit your Subject line so it is more<br>
>> >> specific<br>
>> >> >> >> > than "Re: Contents of yt-users digest..."<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > Today's Topics:<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> >    1. Re: problem with slices in non-unitary volumes (Nathan<br>
>> >> >> Goldbaum)<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >><br>
>> >> >> ----------------------------------------------------------------------<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > Message: 1<br>
>> >> >> >> > Date: Wed, 23 Dec 2015 17:17:56 -0600<br>
>> >> >> >> > From: Nathan Goldbaum <<a href="mailto:nathan12343@gmail.com">nathan12343@gmail.com</a> <mailto:<br>
>> >> >> <a href="mailto:nathan12343@gmail.com">nathan12343@gmail.com</a>>><br>
>> >> >> >> > To: Discussion of the yt analysis package<br>
>> >> >> >> >         <<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a> <mailto:<br>
>> >> >> <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a>>><br>
>> >> >> >> > Subject: Re: [yt-users] problem with slices in non-unitary<br>
>> >> >> >> > volumes<br>
>> >> >> >> > Message-ID:<br>
>> >> >> >> >         <<br>
>> >> >> <a href="mailto:CAJXewOmVEX-qB41doTk%2B7DT1AOLsn53KMb8nvfr8dwyFrKY-4g@mail.gmail.com">CAJXewOmVEX-qB41doTk+7DT1AOLsn53KMb8nvfr8dwyFrKY-4g@mail.gmail.com</a><br>
>> >> >> <mailto:<br>
>> >> >><br>
>> >> >> <a href="mailto:CAJXewOmVEX-qB41doTk%252B7DT1AOLsn53KMb8nvfr8dwyFrKY-4g@mail.gmail.com">CAJXewOmVEX-qB41doTk%2B7DT1AOLsn53KMb8nvfr8dwyFrKY-4g@mail.gmail.com</a>>><br>
>> >> >> >> > Content-Type: text/plain; charset="utf-8"<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > I get the same error over here. I think it's unrelated to the<br>
>> >> other<br>
>> >> >> error.<br>
>> >> >> >> > The relevant portion of the C stack trace is here:<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > Thread 0 Crashed:: Dispatch queue: com.apple.main-thread<br>
>> >> >> >> > 0   libsystem_kernel.dylib         0x00007fff8b615286<br>
>> >> __pthread_kill<br>
>> >> >> + 10<br>
>> >> >> >> > 1   libsystem_c.dylib             0x00007fff8bc2a9ab abort +<br>
>> >> >> >> > 129<br>
>> >> >> >> > 2   libsystem_malloc.dylib         0x00007fff915d5fe2<br>
>> >> >> >> > szone_error<br>
>> >> +<br>
>> >> >> 625<br>
>> >> >> >> > 3   libsystem_malloc.dylib         0x00007fff915cf374<br>
>> >> >> >> > small_free_list_remove_ptr + 154<br>
>> >> >> >> > 4   libsystem_malloc.dylib         0x00007fff915cac3f<br>
>> >> >> >> > szone_free_definite_size + 1856<br>
>> >> >> >> > 5   multiarray.so                 0x00000001044c2d16<br>
>> >> npy_free_cache<br>
>> >> >> + 70<br>
>> >> >> >> > 6   multiarray.so                 0x00000001044c6ed6<br>
>> >> array_dealloc +<br>
>> >> >> 182<br>
>> >> >> >> > 7   selection_routines.so         0x00000001063ffe34<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >><br>
>> >> >> __pyx_pw_2yt_8geometry_18selection_routines_13SliceSelector_3fill_mask<br>
>> >> +<br>
>> >> >> >> > 8804 (selection_routines.c:19749)<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > Line 19749 of selection_routines.c corresponds to line 1158 in<br>
>> >> >> >> > selection_routines.pyx, which is the place where the fill_mask<br>
>> >> member<br>
>> >> >> >> > variable of the SliceSelector extension type gets defined.<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > Unfortunately, I have no idea how to debug this from here...<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > -Nathan<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > On Wed, Dec 23, 2015 at 4:57 PM, Brian O'Shea<br>
>> >> >> >> > <<a href="mailto:bwoshea@gmail.com">bwoshea@gmail.com</a><br>
>> >> >> <mailto:<a href="mailto:bwoshea@gmail.com">bwoshea@gmail.com</a>>> wrote:<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > > Actually, interesting followup here - I have to take it back.<br>
>> >> >> When I do a<br>
>> >> >> >> > > projection plot:<br>
>> >> >> >> > ><br>
>> >> >> >> > >     yt.ProjectionPlot(ds,'x',("gas",<br>
>> >> >> >> > > "temperature"),center=[0.0,0.0,0.0],width=(0.2,'Mpc')).save()<br>
>> >> >> >> > ><br>
>> >> >> >> > > the behavior is perfectly fine and I get projections that<br>
>> >> >> >> > > look<br>
>> >> >> sensible.<br>
>> >> >> >> > >  *however*, when I do a slice plot:<br>
>> >> >> >> > ><br>
>> >> >> >> > >    yt.SlicePlot(ds,'x',("gas",<br>
>> >> >> >> > > "temperature"),center=[0.0,0.0,0.0],width=(0.2,'Mpc')).save()<br>
>> >> >> >> > ><br>
>> >> >> >> > > I get a malloc error:<br>
>> >> >> >> > ><br>
>> >> >> >> > > yt : [INFO     ] 2015-12-23 17:50:59,082 Gathering a field<br>
>> >> >> >> > > list<br>
>> >> >> (this may<br>
>> >> >> >> > > take a moment.)<br>
>> >> >> >> > > yt : [INFO     ] 2015-12-23 17:50:59,155 Loading field<br>
>> >> >> >> > > plugins.<br>
>> >> >> >> > > yt : [INFO     ] 2015-12-23 17:50:59,155 Loaded<br>
>> >> >> >> > > angular_momentum<br>
>> >> >> (8 new<br>
>> >> >> >> > > fields)<br>
>> >> >> >> > > yt : [INFO     ] 2015-12-23 17:50:59,156 Loaded astro (16 new<br>
>> >> >> fields)<br>
>> >> >> >> > > yt : [INFO     ] 2015-12-23 17:50:59,156 Loaded cosmology (23<br>
>> >> new<br>
>> >> >> fields)<br>
>> >> >> >> > > yt : [INFO     ] 2015-12-23 17:50:59,156 Loaded fluid (64 new<br>
>> >> >> fields)<br>
>> >> >> >> > > yt : [INFO     ] 2015-12-23 17:50:59,157 Loaded fluid_vector<br>
>> >> >> >> > > (96<br>
>> >> >> new<br>
>> >> >> >> > > fields)<br>
>> >> >> >> > > yt : [INFO     ] 2015-12-23 17:50:59,157 Loaded geometric<br>
>> >> >> >> > > (112<br>
>> >> new<br>
>> >> >> fields)<br>
>> >> >> >> > > yt : [INFO     ] 2015-12-23 17:50:59,157 Loaded local (112<br>
>> >> >> >> > > new<br>
>> >> >> fields)<br>
>> >> >> >> > > yt : [INFO     ] 2015-12-23 17:50:59,157 Loaded<br>
>> >> >> >> > > magnetic_field<br>
>> >> >> (120 new<br>
>> >> >> >> > > fields)<br>
>> >> >> >> > > yt : [INFO     ] 2015-12-23 17:50:59,158 Loaded my_plugins<br>
>> >> >> >> > > (120<br>
>> >> >> new fields)<br>
>> >> >> >> > > yt : [INFO     ] 2015-12-23 17:50:59,158 Loaded species (122<br>
>> >> >> >> > > new<br>
>> >> >> fields)<br>
>> >> >> >> > > python2.7(12254,0x7fff72d19310) malloc: *** error for object<br>
>> >> >> 0x103e39008:<br>
>> >> >> >> > > incorrect checksum for freed object - object was probably<br>
>> >> modified<br>
>> >> >> after<br>
>> >> >> >> > > being freed.<br>
>> >> >> >> > > *** set a breakpoint in malloc_error_break to debug<br>
>> >> >> >> > > Abort trap: 6<br>
>> >> >> >> > ><br>
>> >> >> >> > > This happens on my Mac (OS X 10.9.5, LLVM v6.0) and also on<br>
>> >> >> >> > > my<br>
>> >> >> Linux<br>
>> >> >> >> > > machine (Ubuntu 13.04, gcc 4.6.3), although on the linux<br>
>> >> machine I<br>
>> >> >> just get<br>
>> >> >> >> > > a seg fault instead of the malloc stuff.  Using pdb (python<br>
>> >> >> >> > > -m<br>
>> >> pdb<br>
>> >> >> >> > > crashing_script.py) gives me the same error with no<br>
>> >> >> >> > > additional<br>
>> >> >> information.<br>
>> >> >> >> > ><br>
>> >> >> >> > ><br>
>> >> >> >> > > On Wed, Dec 23, 2015 at 5:40 PM, Brian O'Shea <<br>
>> >> <a href="mailto:bwoshea@gmail.com">bwoshea@gmail.com</a><br>
>> >> >> <mailto:<a href="mailto:bwoshea@gmail.com">bwoshea@gmail.com</a>>> wrote:<br>
>> >> >> >> > ><br>
>> >> >> >> > >> Bugfix confirmed; this works for me as well.  Thank you very<br>
>> >> much!<br>
>> >> >> >> > >><br>
>> >> >> >> > >> On Wed, Dec 23, 2015 at 5:18 PM, Nathan Goldbaum <<br>
>> >> >> <a href="mailto:nathan12343@gmail.com">nathan12343@gmail.com</a> <mailto:<a href="mailto:nathan12343@gmail.com">nathan12343@gmail.com</a>>><br>
>> >> >> >> > >> wrote:<br>
>> >> >> >> > >><br>
>> >> >> >> > >>> I've opened a pull request that allows me to load your<br>
>> >> dataset:<br>
>> >> >> >> > >>><br>
>> >> >> >> > >>><br>
>> >> >> >> > >>><br>
>> >> >><br>
>> >><br>
>> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=https-3A__bitbucket.org_yt-5Fanalysis_yt_pull-2Drequests_1915_bugfix-2Davoid-2Dcreating-2Dparticle-2Dunions-2Dfor_diff&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=t47Jwha4-PxVj-IMMySjj2pVNuMGW4h7OIQu5juUBsA&e=" rel="noreferrer" target="_blank">https://bitbucket.org/yt_analysis/yt/pull-requests/1915/bugfix-avoid-creating-particle-unions-for/diff</a><br>
>> >> >> <<br>
>> >> >><br>
>> >><br>
>> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=https-3A__bitbucket.org_yt-5Fanalysis_yt_pull-2Drequests_1915_bugfix-2Davoid-2Dcreating-2Dparticle-2Dunions-2Dfor_diff&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=t47Jwha4-PxVj-IMMySjj2pVNuMGW4h7OIQu5juUBsA&e=" rel="noreferrer" target="_blank">https://bitbucket.org/yt_analysis/yt/pull-requests/1915/bugfix-avoid-creating-particle-unions-for/diff</a><br>
>> >> >> ><br>
>> >> >> >> > >>><br>
>> >> >> >> > >>> On Wed, Dec 23, 2015 at 4:08 PM, Brian O'Shea <<br>
>> >> <a href="mailto:bwoshea@gmail.com">bwoshea@gmail.com</a><br>
>> >> >> <mailto:<a href="mailto:bwoshea@gmail.com">bwoshea@gmail.com</a>>> wrote:<br>
>> >> >> >> > >>><br>
>> >> >> >> > >>>> Oh, interesting.  Is there a way to circumvent<br>
>> >> >> >> > >>>> auto-detection<br>
>> >> >> of fields?<br>
>> >> >> >> > >>>><br>
>> >> >> >> > >>>> On Wed, Dec 23, 2015 at 4:35 PM, Nathan Goldbaum <<br>
>> >> >> <a href="mailto:nathan12343@gmail.com">nathan12343@gmail.com</a> <mailto:<a href="mailto:nathan12343@gmail.com">nathan12343@gmail.com</a>><br>
>> >> >> >> > >>>> > wrote:<br>
>> >> >> >> > >>>><br>
>> >> >> >> > >>>>> It looks like field detection is breaking for this<br>
>> >> >> >> > >>>>> Enzo-3.0<br>
>> >> >> active<br>
>> >> >> >> > >>>>> particle dataset. StoredEnergy is available on-disk as<br>
>> >> >> ('AGNParticle,<br>
>> >> >> >> > >>>>> 'StoredEnergy'), but for some reason the field detection<br>
>> >> >> system isn't able<br>
>> >> >> >> > >>>>> to guess that.<br>
>> >> >> >> > >>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>> On Wed, Dec 23, 2015 at 3:19 PM, Nathan Goldbaum <<br>
>> >> >> >> > >>>>> <a href="mailto:nathan12343@gmail.com">nathan12343@gmail.com</a> <mailto:<a href="mailto:nathan12343@gmail.com">nathan12343@gmail.com</a>>><br>
>> >> wrote:<br>
>> >> >> >> > >>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>>> On Wed, Dec 23, 2015 at 11:20 AM, Brian O'Shea <<br>
>> >> >> <a href="mailto:bwoshea@gmail.com">bwoshea@gmail.com</a> <mailto:<a href="mailto:bwoshea@gmail.com">bwoshea@gmail.com</a>>><br>
>> >> >> >> > >>>>>> wrote:<br>
>> >> >> >> > >>>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>>>> Dear yt-users,<br>
>> >> >> >> > >>>>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>>>> I'm having a problem with making slices in non-unitary<br>
>> >> >> volumes.  I<br>
>> >> >> >> > >>>>>>> have a 3D enzo simulation that has domain bounds of<br>
>> >> >> (-1.6...1.6) in every<br>
>> >> >> >> > >>>>>>> dimension (units of megaparsecs), and after I updated<br>
>> >> >> >> > >>>>>>> to<br>
>> >> the<br>
>> >> >> tip of yt-3<br>
>> >> >> >> > >>>>>>> (changeset d9502d848029) from a fairly old version of<br>
>> >> >> >> > >>>>>>> the<br>
>> >> >> code I suddenly<br>
>> >> >> >> > >>>>>>> have problems with making simple projections.  If I run<br>
>> >> this<br>
>> >> >> set of<br>
>> >> >> >> > >>>>>>> commands:<br>
>> >> >> >> > >>>>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>>> Any idea which version you updated from? I tried on<br>
>> >> >> >> > >>>>>> yt-3.1<br>
>> >> >> and get<br>
>> >> >> >> > >>>>>> the same error. This is just so we can bisect and find<br>
>> >> >> >> > >>>>>> the<br>
>> >> >> change that<br>
>> >> >> >> > >>>>>> introduced the regression.<br>
>> >> >> >> > >>>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>>>> import yt<br>
>> >> >> >> > >>>>>>> ds = yt.load("DD0400/DD0400")<br>
>> >> >> >> > >>>>>>> proj =<br>
>> >> >> >> > >>>>>>><br>
>> >> >><br>
>> >><br>
>> >> yt.SlicePlot(ds,'x','temperature',center=[0.0,0.0,0.0],width=(0.2,'Mpc'))<br>
>> >> >> >> > >>>>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>>>> I get this error:<br>
>> >> >> >> > >>>>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>>>> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__paste.yt-2Dproject.org_show_6115_&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=dTLZF-XAIb_qJIJK_UHs1YKWu5GmJnlYZhEval1RNzU&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://paste.yt-project.org/show/6115/</a> <<br>
>> >> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__paste.yt-2Dproject.org_show_6115_&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=dTLZF-XAIb_qJIJK_UHs1YKWu5GmJnlYZhEval1RNzU&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://paste.yt-project.org/show/6115/</a>><br>
>> >> >> >> > >>>>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>>>> This seems to work fine on an Enzo cosmological dataset<br>
>> >> >> (domain<br>
>> >> >> >> > >>>>>>> bounds 0-1 in each dimension), and previously worked<br>
>> >> >> >> > >>>>>>> fine<br>
>> >> in<br>
>> >> >> yt-3 (using a<br>
>> >> >> >> > >>>>>>> version of the code from a couple of months ago).<br>
>> >> >> >> > >>>>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>>>> is this a bug, or am I doing something dumb?<br>
>> >> >> >> > >>>>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>>>> Thanks!<br>
>> >> >> >> > >>>>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>>>> --Brian<br>
>> >> >> >> > >>>>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>>>> _______________________________________________<br>
>> >> >> >> > >>>>>>> yt-users mailing list<br>
>> >> >> >> > >>>>>>> <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a> <mailto:<br>
>> >> >> <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a>><br>
>> >> >> >> > >>>>>>><br>
>> >> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lists.spacepope.org_listinfo.cgi_yt-2Dusers-2Dspacepope.org&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=AzQNn1-DSkRQT72NQ7392PQzULhDse4Ct4JD3xqnfek&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a> <<br>
>> >> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lists.spacepope.org_listinfo.cgi_yt-2Dusers-2Dspacepope.org&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=AzQNn1-DSkRQT72NQ7392PQzULhDse4Ct4JD3xqnfek&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a>><br>
>> >> >> >> > >>>>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>> _______________________________________________<br>
>> >> >> >> > >>>>> yt-users mailing list<br>
>> >> >> >> > >>>>> <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a> <mailto:<br>
>> >> >> <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a>><br>
>> >> >> >> > >>>>><br>
>> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lists.spacepope.org_listinfo.cgi_yt-2Dusers-2Dspacepope.org&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=AzQNn1-DSkRQT72NQ7392PQzULhDse4Ct4JD3xqnfek&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
>> >> >> <<a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lists.spacepope.org_listinfo.cgi_yt-2Dusers-2Dspacepope.org&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=AzQNn1-DSkRQT72NQ7392PQzULhDse4Ct4JD3xqnfek&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a>><br>
>> >> >> >> > >>>>><br>
>> >> >> >> > >>>>><br>
>> >> >> >> > >>>><br>
>> >> >> >> > >>>> _______________________________________________<br>
>> >> >> >> > >>>> yt-users mailing list<br>
>> >> >> >> > >>>> <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a> <mailto:<br>
>> >> >> <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a>><br>
>> >> >> >> > >>>><br>
>> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lists.spacepope.org_listinfo.cgi_yt-2Dusers-2Dspacepope.org&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=AzQNn1-DSkRQT72NQ7392PQzULhDse4Ct4JD3xqnfek&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
>> >> >> <<a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lists.spacepope.org_listinfo.cgi_yt-2Dusers-2Dspacepope.org&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=AzQNn1-DSkRQT72NQ7392PQzULhDse4Ct4JD3xqnfek&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a>><br>
>> >> >> >> > >>>><br>
>> >> >> >> > >>>><br>
>> >> >> >> > >>><br>
>> >> >> >> > >>> _______________________________________________<br>
>> >> >> >> > >>> yt-users mailing list<br>
>> >> >> >> > >>> <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a> <mailto:<br>
>> >> >> <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a>><br>
>> >> >> >> > >>><br>
>> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lists.spacepope.org_listinfo.cgi_yt-2Dusers-2Dspacepope.org&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=AzQNn1-DSkRQT72NQ7392PQzULhDse4Ct4JD3xqnfek&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a> <<br>
>> >> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lists.spacepope.org_listinfo.cgi_yt-2Dusers-2Dspacepope.org&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=AzQNn1-DSkRQT72NQ7392PQzULhDse4Ct4JD3xqnfek&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a>><br>
>> >> >> >> > >>><br>
>> >> >> >> > >>><br>
>> >> >> >> > >><br>
>> >> >> >> > ><br>
>> >> >> >> > > _______________________________________________<br>
>> >> >> >> > > yt-users mailing list<br>
>> >> >> >> > > <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a> <mailto:<br>
>> >> <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a>><br>
>> >> >> >> > ><br>
>> >> >> >> > > <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lists.spacepope.org_listinfo.cgi_yt-2Dusers-2Dspacepope.org&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=AzQNn1-DSkRQT72NQ7392PQzULhDse4Ct4JD3xqnfek&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
>> >> <<br>
>> >> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lists.spacepope.org_listinfo.cgi_yt-2Dusers-2Dspacepope.org&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=AzQNn1-DSkRQT72NQ7392PQzULhDse4Ct4JD3xqnfek&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a>><br>
>> >> >> >> > ><br>
>> >> >> >> > ><br>
>> >> >> >> > -------------- next part --------------<br>
>> >> >> >> > An HTML attachment was scrubbed...<br>
>> >> >> >> > URL: <<br>
>> >> >><br>
>> >><br>
>> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lists.spacepope.org_pipermail_yt-2Dusers-2Dspacepope.org_attachments_20151223_0739ada6_attachment.html&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=kF3BKxdmh7pmHtBQwNo8dhw8AjOXxKzTR5XLkiiFctk&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/pipermail/yt-users-spacepope.org/attachments/20151223/0739ada6/attachment.html</a><br>
>> >> >> <<br>
>> >> >><br>
>> >><br>
>> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lists.spacepope.org_pipermail_yt-2Dusers-2Dspacepope.org_attachments_20151223_0739ada6_attachment.html&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=kF3BKxdmh7pmHtBQwNo8dhw8AjOXxKzTR5XLkiiFctk&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/pipermail/yt-users-spacepope.org/attachments/20151223/0739ada6/attachment.html</a><br>
>> >> >> >><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > ------------------------------<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > Subject: Digest Footer<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > _______________________________________________<br>
>> >> >> >> > yt-users mailing list<br>
>> >> >> >> > <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
>> >> >> >> > <mailto:<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
>> >> ><br>
>> >> >> >> > <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lists.spacepope.org_listinfo.cgi_yt-2Dusers-2Dspacepope.org&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=AzQNn1-DSkRQT72NQ7392PQzULhDse4Ct4JD3xqnfek&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
>> >> >> >> > <<br>
>> >> >> <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lists.spacepope.org_listinfo.cgi_yt-2Dusers-2Dspacepope.org&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=AzQNn1-DSkRQT72NQ7392PQzULhDse4Ct4JD3xqnfek&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a>><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > ------------------------------<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > End of yt-users Digest, Vol 94, Issue 24<br>
>> >> >> >> > ****************************************<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > --<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > SK2<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > "Claiming that something can move faster than light is a good<br>
>> >> >> conversation-stopper in physics. People edge away from you in<br>
>> >> >> cocktail<br>
>> >> >> parties; friends never return phone calls. You just don?t mess with<br>
>> >> Albert<br>
>> >> >> Einstein."<br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> ><br>
>> >> >> >> > _______________________________________________<br>
>> >> >> >> > yt-users mailing list<br>
>> >> >> >> > <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
>> >> >> >> > <mailto:<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
>> >> ><br>
>> >> >> >> > <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lists.spacepope.org_listinfo.cgi_yt-2Dusers-2Dspacepope.org&d=BQMFaQ&c=8hUWFZcy2Z-Za5rBPlktOQ&r=hgcBC3x6dKFoTrmFmMYYbKNfiHZlGLKliIidd1LwmHI&m=_aYsEBlHNaW2FOvgQwJekaP8Ad64KS0CLqWtDMVo2DU&s=AzQNn1-DSkRQT72NQ7392PQzULhDse4Ct4JD3xqnfek&e=" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
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>> >> >> conversation-stopper in physics. People edge away from you in<br>
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>> > conversation-stopper in physics. People edge away from you in cocktail<br>
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