<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small">I'm trying to plot 3D streamlines from a FLASH (v.4) dataset. I've based my streamlines script off the version presented on the <a href="http://yt-project.org">yt-project.org</a> website.</div><div class="gmail_default" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small">I consistently get an error about going up the ghost cells in my volume. The error message is:</div><div class="gmail_default" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:small"><br></div><div class="gmail_default"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><font face="arial, helvetica, sans-serif">RuntimeError: Error: yt attempted to read outside the boundaries of a non-periodic domain along dimension 0.<br></font><font face="arial, helvetica, sans-serif">Region left edge = -3e+18 code_length, Region right edge = 4.5e+18 code_length<br></font><font face="arial, helvetica, sans-serif">Dataset left edge = 0.0 code_length, Dataset right edge = 1.2e+19 code_length</font><font face="arial, helvetica, sans-serif"><br></font><font face="arial, helvetica, sans-serif">This commonly happens when trying to compute ghost cells up to the domain boundary. Two possible solutions are to load a smaller region that does not border the edge or override the periodicity for this dataset.</font></blockquote><div><br></div><div>My FLASH datasets have x/y/zmin = 0.0 and x/y/zmax 1.2e19 cm.</div><div><br></div><div>I seems like yt is trying to read outside my domain, or is bumping up against the guardcells and I have no idea how to prevent it from doing this. I have tried inspecting the code for an obvious solution. A very similar error shows up when I try to make 1D profiles of the entire dataset (dd = ds.all_data()).</div><div><br></div><div>is it possible that yt doesn't support volumes where the (0,0,0) coordinate is a corner of the volume? Any easy solution to the above issue?</div><div><br></div><div>Thanks,</div><div>Mikhail</div></div></div>