How did mpi4py get installed? <div><br></div><div>You may need to troubleshoot this with the Stampede sysadmins, since the error is being raised by the MPI library you're using.<span></span></div><div><br>On Sunday, July 5, 2015, rahul kashyap <<a href="mailto:rahulkashyap411@gmail.com">rahulkashyap411@gmail.com</a>> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Dear yt-users,<div><br></div><div>I'm trying to use parallel yt on stampede and got this error --<br></div><div><div>LiMIC: (limic_open) file open fail</div><div>[unset]: aborting job:</div><div>Fatal error in PMPI_Init_thread:</div><div>Other MPI error, error stack:</div><div>MPIR_Init_thread(436)....: </div><div>MPID_Init(371)...........: channel initialization failed</div><div>MPIDI_CH3_Init(335)......: </div><div>MPIDI_CH3I_SMP_Init(1723): LiMIC2 device does not exist: No such file or directory</div></div><div><br></div><div>In the interactive ipython, import yt and import mpi4py works ok but, yt.enable_parallelism() gives the same error. </div><div>Serial scripts runs perfectly fine. I've also tried building mpi4py by specifying mpicc path; itdoesn't work.</div><div><br></div><div>Any help would be highly appreciated. Thanks in advance.</div><div><br></div><div>rahul</div><div><br></div><div><br></div></div>
</blockquote></div>