<div dir="ltr">Hi folks,<div><br></div><div>I'm having some problems creating a time series of halo catalogs with Rockstar on a small cosmology run, using the tip of yt 3.2-dev (changeset a2b03516ed2c) with mpi4py v1.3.1 (and OpenMPI v1.4.3) installed on a local Linux cluster.  </div><div><br></div><div>I'm pretty confident that it has something specifically to do with a time series. When I use this script to call rockstar on a single dataset:</div><div><br></div><div>    <a href="http://paste.yt-project.org/show/5586/">http://paste.yt-project.org/show/5586/</a><br></div><div><br></div><div>with this command line:</div><div><br></div><div>    mpirun -np 8 --mca btl ^openib python new_rockstar_ts.py --parallel<br></div><div><br></div><div>everything works just fine, and does so for every RDNNNN dataset.  However, when I uncomment lines 40-44 and comment out lines 47-53 in the same script (i.e., like this: <a href="http://paste.yt-project.org/show/5587/">http://paste.yt-project.org/show/5587/</a>) so that the code now uses a time series of all of the RDNNNN datasets rather than a single dataset, and use the same command line, I immediately get a seg fault that appears to be related to the mpi4py package:</div><div><br></div><div><a href="http://paste.yt-project.org/show/5588/">http://paste.yt-project.org/show/5588/</a><br></div><div><br></div><div>The datasets that I'm using for the time series can be found here:</div><div><br></div><div><a href="http://galactica.pa.msu.edu/~bwoshea/data/datasets/rockstar_timeseries.tar.gz">http://galactica.pa.msu.edu/~bwoshea/data/datasets/rockstar_timeseries.tar.gz</a><br></div><div><br></div><div>(total size ~300 MB).</div><div><br></div><div>Does anybody have any idea what's going on?</div><div><br></div><div>Thanks!</div><div><br></div><div>--Brian</div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div></div>