<div dir="ltr"><div><div><div>Yeah I think this is getting closer to the solution now. I reckon I was constantly pulling from yt-3.0 - not sure why that happened of course. <br></div> I've been doing hg log | head and I see the last entry was December last year - not good :)<br><br></div>I've now started over and cloned from <br><span>hg clone ssh://<a href="http://hg@bitbucket.org/yt_analysis/yt">hg@bitbucket.org/yt_analysis/yt</a><br><br></span></div><span>hopefully that solve all my troubles (well my YT ones at least....)<br></span><div><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Sep 15, 2014 at 3:02 PM, Britton Smith <span dir="ltr"><<a href="mailto:brittonsmith@gmail.com" target="_blank">brittonsmith@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Ah, yes, the repo is actually <a href="http://bitbucket.org/yt_analysis/yt" target="_blank">bitbucket.org/yt_analysis/yt</a><div>The one you have there was the original development repo from a while back.  Since, then development was merged into the main repo (yt, not yt-3.0).</div><div><br></div><div>You can always do "hg log -l 1" after "hg pull" to see the log of the very latest change in that repo.  yt development happens fast enough that if that the date on that changeset is from more than a month ago, it's likely you're not getting the latest changes.</div></div><div class="HOEnZb"><div class="h5"><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Sep 15, 2014 at 12:48 PM, John Regan <span dir="ltr"><<a href="mailto:johnanthonyregan@gmail.com" target="_blank">johnanthonyregan@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Running "hg pull" seems to indicate that I am up2date but like you said there does seem to be a problem with my repos<br><br>(yt-x86_64)[regan@taito-login3 yt-3.0]$ hg pull<br>pulling from ssh://<a href="http://hg@bitbucket.org/yt_analysis/yt-3.0" target="_blank">hg@bitbucket.org/yt_analysis/yt-3.0</a><br>searching for changes<br>no changes found<br>(yt-x86_64)[regan@taito-login3 yt-3.0]$ hg up yt<br>0 files updated, 0 files merged, 0 files removed, 0 files unresolved<br><br></div>Is there an easy to check if I am on the tip to see if my repos is actually OK or not?<br><div><div><br></div></div></div><div><div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Sep 15, 2014 at 2:37 PM, Britton Smith <span dir="ltr"><<a href="mailto:brittonsmith@gmail.com" target="_blank">brittonsmith@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">I think your repo is probably missing most of the latest changes.  Make sure you "hg pull" before you do "hg up yt" and python setup.py develop.</div><div><div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Sep 15, 2014 at 12:30 PM, John Regan <span dir="ltr"><<a href="mailto:johnanthonyregan@gmail.com" target="_blank">johnanthonyregan@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div><div>I ran "python setup.py develop" which I think I missed before when trying to switch to the new branch. At the end of the output there are some weird lines:<br><br>Creating /homeappl/home/regan/appl_taito/YT/Dev-3.0/yt-3.0/doc/yt-x86_64/lib/python2.7/site-packages/yt.egg-link (link to .)<br>yt 2.6dev is already the active version in easy-install.pth<br>Installing yt script to /homeappl/home/regan/appl_taito/YT/Dev-3.0/yt-3.0/doc/yt-x86_64/bin<br>Installing pyro_queue.py script to /homeappl/home/regan/appl_taito/YT/Dev-3.0/yt-3.0/doc/yt-x86_64/bin<br>Installing yt_lodgeit.py script to /homeappl/home/regan/appl_taito/YT/Dev-3.0/yt-3.0/doc/yt-x86_64/bin<br>Installing iyt script to /homeappl/home/regan/appl_taito/YT/Dev-3.0/yt-3.0/doc/yt-x86_64/bin<br><br>Installed /homeappl/home/regan/appl_taito/YT/Dev-3.0/yt-3.0<br>Processing dependencies for yt==2.6dev<br>Finished processing dependencies for yt==2.6dev<br><br></div>It looks like it is updating to the 2.6dev for some reason. <br></div>The changeset is c53475f4d73a now. <br><br></div>The script also still fails in the same way as before - it seems I'm still not on the 3.0 dev branch?<br><div><br></div></div><div><div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Sep 15, 2014 at 2:09 PM, Britton Smith <span dir="ltr"><<a href="mailto:brittonsmith@gmail.com" target="_blank">brittonsmith@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Ah, ok, that changeset is in the yt-3.0 branch, which has been all but closed.  Development for yt-3.0 has moved to the yt branch.  You'll need to "hg pull ; hg up yt" and do another "python setup.py develop" and I think you'll be ok then.</div><div><div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Sep 15, 2014 at 12:05 PM, John Regan <span dir="ltr"><<a href="mailto:johnanthonyregan@gmail.com" target="_blank">johnanthonyregan@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">The latest I hope :)<span><br><br>(yt-x86_64)[regan@taito-login3 RT]$ yt instinfo<br><br>yt module located at:<br>    /homeappl/home/regan/appl_<div>taito/YT/Dev-3.0/yt-3.0<br><br>The current version of the code is:<br><br>---<br>38fff02747ca<br>---<br><br>This installation CAN be automatically updated.<br>yt dependencies were last updated on<br>Mon Sep 15 12:40:51 EEST 2014<br><br><br>(yt-x86_64)[regan@taito-login3 RT]$ which pyyt<br>/homeappl/home/regan/appl_taito/YT/Dev-3.0/yt-3.0/doc/yt-x86_64/bin/pyyt</div><br></span></div><div><div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Sep 15, 2014 at 2:03 PM, Britton Smith <span dir="ltr"><<a href="mailto:brittonsmith@gmail.com" target="_blank">brittonsmith@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">What changeset of yt are you on?  What do you get with "yt instinfo"?</div><div><div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Sep 15, 2014 at 11:57 AM, John Regan <span dir="ltr"><<a href="mailto:johnanthonyregan@gmail.com" target="_blank">johnanthonyregan@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div>It 50% works in that case. <br><br></div>load works but ProfilePlot fails!<span><br><br> File "test.py", line 9, in <module><br>    prof1d = ProfilePlot(sphere, "radius", "H2I_Fraction")<br>NameError: name 'ProfilePlot' is not defined<br><br></span></div>Totally confused :)<br></div><div><div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Sep 15, 2014 at 1:54 PM, Britton Smith <span dir="ltr"><<a href="mailto:brittonsmith@gmail.com" target="_blank">brittonsmith@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Hi John,</div><div><br></div>D'oh, sorry, that's what I get for trying to answer emails before enough coffee.<div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">Question, if you do "from yt.mods import *" and remove the yt from yt.load and yt.ProfilePlot, do things work?</div><span><font color="#888888"><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">Britton</div></font></span><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote"><span>On Mon, Sep 15, 2014 at 10:56 AM, John Regan <span dir="ltr"><<a href="mailto:johnanthonyregan@gmail.com" target="_blank">johnanthonyregan@gmail.com</a>></span> wrote:<br></span><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div><div dir="ltr"><div><div><div>Hi All, <br><br></div>I'm having some teething problems with 3.0. <br></div>It seems that I have a conflict somewhere but I can't see where. For example I have a very simple script which is doing weird things<br><br></div>#Simple simple script<br><div>import yt<br>filename = "....../RD0000/RD0000"<br>ds = yt.load(filename)<br><br><br></div><div>This fails with:<br><br>File "test.py", line 6, in <module><br>    ds = yt.load(filename)<br>AttributeError: 'module' object has no attribute 'load'<br><br></div><div>If instead I change the script to be:<br><br></div><div>#Simple simple script<br></div><div>from yt.mods import *<br>filename = "......../RD0000/RD0000"<br>ds = load(filename)<br>sp = ds.h.sphere('max', (10, 'kpc'))<br>prof1d = ProfilePlot(sphere, "radius", "H2I_Fraction")<br><br></div><div>This now loads the file but fails on:<br> File "test.py", line 9, in <module><br>    prof1d = ProfilePlot(sphere, "radius", "H2I_Fraction")<br>NameError: name 'ProfilePlot' is not defined<br><br><br></div><div>Any ideas what's happening here?<br><br></div><div>Cheers,<br>John<br><br></div><div><br>(yt-x86_64)[regan@taito-login3 RT]$ yt instinfo<br><br>yt module located at:<br>    /homeappl/home/regan/appl_taito/YT/Dev-3.0/yt-3.0<br><br>The current version of the code is:<br><br>---<br>38fff02747ca<br>---<br><br>This installation CAN be automatically updated.<br>yt dependencies were last updated on<br>Mon Sep 15 12:40:51 EEST 2014<br><br><br>(yt-x86_64)[regan@taito-login3 RT]$ which pyyt<br>/homeappl/home/regan/appl_taito/YT/Dev-3.0/yt-3.0/doc/yt-x86_64/bin/pyyt<br><br></div></div>
<br></div></div><span>_______________________________________________<br>
yt-users mailing list<br>
<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org" target="_blank">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
<br></span></blockquote></div><br></div></div>
<br>_______________________________________________<br>
yt-users mailing list<br>
<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org" target="_blank">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>
</div></div><br>_______________________________________________<br>
yt-users mailing list<br>
<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org" target="_blank">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>
</div></div><br>_______________________________________________<br>
yt-users mailing list<br>
<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org" target="_blank">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>
</div></div><br>_______________________________________________<br>
yt-users mailing list<br>
<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org" target="_blank">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>
</div></div><br>_______________________________________________<br>
yt-users mailing list<br>
<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org" target="_blank">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>
</div></div><br>_______________________________________________<br>
yt-users mailing list<br>
<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org" target="_blank">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>
</div></div><br>_______________________________________________<br>
yt-users mailing list<br>
<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org" target="_blank">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>
</div></div><br>_______________________________________________<br>
yt-users mailing list<br>
<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org" target="_blank">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>
</div></div><br>_______________________________________________<br>
yt-users mailing list<br>
<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>