<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1"><div dir="ltr">Cool, that seems to have run ok! But it didn't generate the bin/activate script? </div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Tue, May 13, 2014 at 3:21 PM, Kacper Kowalik <span dir="ltr"><<a href="mailto:xarthisius.kk@gmail.com" target="_blank">xarthisius.kk@gmail.com</a>></span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">On 13.05.2014 20:00, Kaylea Nelson wrote:<br>
> Hi Matt,<br>
<div><div class="h5"><br>
> Failure.  Check<br>
> /home/fas/nagai/kln26/programs/yt_dir/yt_bleedingedge/yt-x86_64/yt_install.log.<br>
>  The last 10 lines are above.<br>
><br>
><br>
> On a related note, whenever I install either version, the install also<br>
> fails when installing ZeroMQ:<br>
><br>
> Installing mercurial-3.0<br>
> Setting<br>
> YT_DIR=/home/fas/nagai/kln26/programs/yt_dir/yt_bleedingedge/yt-x86_64/src/yt-hg/<br>
> Installing distribute<br>
> Installing pip<br>
> Installing numpy-1.7.1<br>
> Installing matplotlib-1.3.0<br>
> Installing ZeroMQ<br>
> ********************************************<br>
>         FAILURE REPORT:<br>
> ********************************************<br>
><br>
>   CXX    libzmq_la-ipc_address.lo<br>
>   CXX    libzmq_la-ipc_connecter.lo<br>
> stream_engine.hpp(97): error #82: storage class is not first<br>
>           const static size_t greeting_size = 12;<br>
>                 ^<br>
><br>
> compilation aborted for ipc_connecter.cpp (code 2)<br>
> make[1]: *** [libzmq_la-ipc_connecter.lo] Error 1<br>
> make[1]: Leaving directory<br>
> `/lustre/home/client/fas/nagai/kln26/programs/yt_dir/yt_bleedingedge/yt-x86_64/src/zeromq-3.2.4/src'<br>
> make: *** [install-recursive] Error 1<br>
><br>
> ********************************************<br>
> ********************************************<br>
> Failure.  Check<br>
> /home/fas/nagai/kln26/programs/yt_dir/yt_bleedingedge/yt-x86_64/yt_install.log.<br>
>  The last 10 lines are above.<br>
><br>
> But I just fix the const static to static const in stream_engine.hpp and it<br>
> gets past that particular error (in the stable version anyway). Let me know<br>
> if I shouldn't be messing with that.<br>
><br>
> Actually, it appears to get YT_DIR the correctly the first time through,<br>
> but when I restart it after fixing the ZeroMQ bug, it fails to set YT_DIR.<br>
> So, just to be extra thorough, I tried manually setting YT_DIR on l.54 to<br>
> /home/fas/nagai/kln26/programs/yt_dir/yt_bleedingedge/yt-x86_64/src/yt-hg/<br>
> (as it was set the first time). If I do this, it gets past the above error<br>
> and I ultimately get the same error as for the stable version (the original<br>
> reason of this email):<br>
><br>
> [hit enter]<br>
><br>
> Awesome!  Here we go.<br>
><br>
> Using wget<br>
> Using sha512sum<br>
> Downloading xray_emissivity.h5 from <a href="http://yt-project.org" target="_blank">yt-project.org</a><br>
> Installing distribute<br>
> Installing pip<br>
> Installing ZeroMQ<br>
> Installing pyzmq-13.1.0 (arguments:<br>
> '--zmq=/home/fas/nagai/kln26/programs/yt_dir/yt_bleedingedge/yt-x86_64')<br>
> Installing tornado-3.1<br>
> Installing ipython-1.1.0<br>
> Installing h5py-2.1.3<br>
> Installing Cython-0.19.1<br>
> Installing Forthon-0.8.11<br>
> Installing nose-1.3.0<br>
> Installing python-hglib-1.0<br>
> Installing sympy-0.7.3<br>
<br>
</div></div>Hi Kaylea!<br>
<br>
[snip]<br>
<div class="">> Doing yt update, wiping local changes and updating to branch yt-3.0<br>
> Installing yt<br>
<br>
</div>[snip]<br>
<br>
at this point you should have everything that's required to build yt.<br>
Let's try to install it manually outside of the install_script.sh.<br>
Setting following env vars should do the trick:<br>
<br>
export<br>
YT_DIR=/home/fas/nagai/kln26/programs/yt_dir/yt_bleedingedge/yt-x86_64<br>
export PATH=$YT_DIR/bin:$PATH<br>
export LD_LIBRARY_PATH=$YT_DIR/lib:$LD_LIBRARY_PATH<br>
export PYTHONPATH=$YT_DIR/lib/python2.7/site-packages:$PYTHONPATH<br>
export HDF5_DIR=$YT_DIR<br>
export PNG_DIR=$YT_DIR<br>
<br>
then<br>
<br>
cd $YT_DIR/src/yt-hg<br>
hg update -C yt-3.0<br>
python setup.py install --prefix=$YT_DIR<br>
<br>
Could you please try it out? In the mean time I'll try to setup Red Hat<br>
6 based environment to reproduce your issue.<br>
<br>
Cheers,<br>
Kacper<br>
<br>
<br>
<br>_______________________________________________<br>
yt-users mailing list<br>
<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>