<div dir="ltr"><div>Setting HOME to the working directory worked! Thank you so much!</div><div><br></div><div>-Hilary</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">

Hi Hilary,<br>
This is increasingly looking like a matplotlib bug -- but there is one<br>other thing you could try.  Looking at the matplotlib source, it looks<br>like it checks HOME, USERPROFILE and TMP to see if they are None.  So<br>

you could try setting one of those three variables to the current<br>working directory of your script.  Otherwise, maybe file an issue with<br>matplotlib?<br>
Sorry ... :(<br>
-Matt<br>
On Thu, Oct 10, 2013 at 12:49 PM, Hilary Egan <<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org">hilaryye at gmail.com</a>> wrote:<br>><i> Unfortunately setting XDG_CONFIG_HOME as the working directory didn't work.<br>


</i>><i> I get this error message <a href="http://paste.yt-project.org/show/3941/">http://paste.yt-project.org/show/3941/</a> which<br>
</i>><i> appears to be the same problem as before.<br>
</i>><br>><i> -Hilary<br>
</i>><br>>><i> ________________________________<br>
</i>>><br>>><i> Hi Hilary,<br>
</i>>><br>>><i> Yeah ... this is actually a problem with funny home directories and<br>
</i>>><i> Matplotlib 1.3.0.  I think this is a problem specific to machines<br>
</i>>><i> where the home directories aren't visible.  You may be able to either<br>
</i>>><i> set the environment variable XDG_CONFIG_HOME to the working directory<br>
</i>>><i> for some success.<br>
</i>>><br>>><i> Additionally, I think that yt.pmods no longer works with matplotlib<br>
</i>>><i> 1.3.0, too, but it looks like you're using yt.mods, so that's good.<br>
</i>>><br>>><i> Could you let us know if that works?<br>
</i>>><br>>><i> -Matt<br>
</i>>><br>>><i> On Wed, Oct 9, 2013 at 10:42 PM, Hilary Egan <hilaryye at <a href="http://gmail.com">gmail.com</a>><br>
</i>>><i> wrote:<br>
</i>>><i> > Perhaps inadvisedly I'm trying to get parallel yt to work on kraken. As<br>
</i>>><i> > suggested in the docs faq I made sure I loaded the PrgEnv-gnu module and<br>
</i>>><i> > pip<br>
</i>>><i> > installed mpi4py with env MPICC=cc. Although this worked fine as is on<br>
</i>>><i> > my<br>
</i>>><i> > local machine, yt then complained about missing libraries, I guessed<br>
</i>>><i> > because<br>
</i>>><i> > of some sort of static linking/build problem, so I copied all of the<br>
</i>>><i> > libraries it complained about to $YT_DIR/lib (full list is below). Now<br>
</i>>><i> > it's<br>
</i>>><i> > giving me a completely indecipherable message about matplotlib which<br>
</i>>><i> > I've<br>
</i>>><i> > copied here: <a href="http://paste.yt-project.org/show/3939/">http://paste.yt-project.org/show/3939/.</a> I only see this<br>
</i>>><i> > error<br>
</i>>><i> > when I try and run yt with the --parallel flag, so I'm guessing it must<br>
</i>>><i> > be<br>
</i>>><i> > related. Any advice would be greatly appreciated!<br>
</i>>><i> ><br>
</i>>><i> > Thanks,<br>
</i>>><i> > Hilary<br>
</i>>><i> ><br>
</i>>><i> > ______<br>
</i>>><i> ><br>
</i>>><i> > Missing libraries yt complained about and I added:<br>
</i>>><i> ><br>
</i>>><i> > libgfortran.so.3<br>
</i>>><i> > libscicpp_gnu.so.1<br>
</i>>><i> > libsci_gnu_mp.so.1<br>
</i>>><i> > libstdc++.so.6<br>
</i>>><i> > libfttw3.so.3<br>
</i>>><i> > libfftw3f.so.3<br>
</i>>><i> > libmpich_gnu.so.gnu-46-1<br>
</i>>><i> > libmpl.so.0<br>
</i>>><i> > libpmi.so.0<br>
</i>>><i> > libgomp.so.1<br>
</i>>><i> > libquadmath.so.0<br>
</i>>><i> > libmpich.so.1<br>
</i>>><i> > libgcc_s.so.1<br>
</i>>><i> > libportals.so.1<br>
</i>>><i> > libalpsutil.so<br>
</i>>><i> > libalpslli.so<br>
</i>>><i> ><br>
</i>>><i> ><br>
</i>>><i> > _______________________________________________<br>
</i>>><i> > yt-users mailing list<br>
</i>>><i> > yt-users at <a href="http://lists.spacepope.org">lists.spacepope.org</a><br>
</i>>><i> > <a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org<br></a>
</i>>><br>>><br>><br>><i> _______________________________________________<br>
</i>><i> yt-users mailing list<br>
</i>><i> <a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org">yt-users at lists.spacepope.org<br></a>
</i>><i> <a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org<br></a>
</i>><hr style="color:rgb(0,0,0);font-family:Times;font-size:medium"></blockquote><p style="color:rgb(0,0,0);font-family:Times;font-size:medium"></p><ul style="color:rgb(0,0,0);font-family:Times;font-size:medium"></ul>

</div>