<div dir="ltr">Hi Hilary,<div><br></div><div>It occurs to me that you might also be able to get away with using matplotlib 1.2.1.</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Oct 10, 2013 at 10:03 AM, Matthew Turk <span dir="ltr"><<a href="mailto:matthewturk@gmail.com" target="_blank">matthewturk@gmail.com</a>></span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Hilary,<br>
<br>
This is increasingly looking like a matplotlib bug -- but there is one<br>
other thing you could try.  Looking at the matplotlib source, it looks<br>
like it checks HOME, USERPROFILE and TMP to see if they are None.  So<br>
you could try setting one of those three variables to the current<br>
working directory of your script.  Otherwise, maybe file an issue with<br>
matplotlib?<br>
<br>
Sorry ... :(<br>
<br>
-Matt<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
On Thu, Oct 10, 2013 at 12:49 PM, Hilary Egan <<a href="mailto:hilaryye@gmail.com">hilaryye@gmail.com</a>> wrote:<br>
> Unfortunately setting XDG_CONFIG_HOME as the working directory didn't work.<br>
> I get this error message <a href="http://paste.yt-project.org/show/3941/" target="_blank">http://paste.yt-project.org/show/3941/</a> which<br>
> appears to be the same problem as before.<br>
><br>
> -Hilary<br>
><br>
>> ________________________________<br>
>><br>
>> Hi Hilary,<br>
>><br>
>> Yeah ... this is actually a problem with funny home directories and<br>
>> Matplotlib 1.3.0.  I think this is a problem specific to machines<br>
>> where the home directories aren't visible.  You may be able to either<br>
>> set the environment variable XDG_CONFIG_HOME to the working directory<br>
>> for some success.<br>
>><br>
>> Additionally, I think that yt.pmods no longer works with matplotlib<br>
>> 1.3.0, too, but it looks like you're using yt.mods, so that's good.<br>
>><br>
>> Could you let us know if that works?<br>
>><br>
>> -Matt<br>
>><br>
>> On Wed, Oct 9, 2013 at 10:42 PM, Hilary Egan <hilaryye at <a href="http://gmail.com" target="_blank">gmail.com</a>><br>
>> wrote:<br>
>> > Perhaps inadvisedly I'm trying to get parallel yt to work on kraken. As<br>
>> > suggested in the docs faq I made sure I loaded the PrgEnv-gnu module and<br>
>> > pip<br>
>> > installed mpi4py with env MPICC=cc. Although this worked fine as is on<br>
>> > my<br>
>> > local machine, yt then complained about missing libraries, I guessed<br>
>> > because<br>
>> > of some sort of static linking/build problem, so I copied all of the<br>
>> > libraries it complained about to $YT_DIR/lib (full list is below). Now<br>
>> > it's<br>
>> > giving me a completely indecipherable message about matplotlib which<br>
>> > I've<br>
>> > copied here: <a href="http://paste.yt-project.org/show/3939/" target="_blank">http://paste.yt-project.org/show/3939/</a>. I only see this<br>
>> > error<br>
>> > when I try and run yt with the --parallel flag, so I'm guessing it must<br>
>> > be<br>
>> > related. Any advice would be greatly appreciated!<br>
>> ><br>
>> > Thanks,<br>
>> > Hilary<br>
>> ><br>
>> > ______<br>
>> ><br>
>> > Missing libraries yt complained about and I added:<br>
>> ><br>
>> > libgfortran.so.3<br>
>> > libscicpp_gnu.so.1<br>
>> > libsci_gnu_mp.so.1<br>
>> > libstdc++.so.6<br>
>> > libfttw3.so.3<br>
>> > libfftw3f.so.3<br>
>> > libmpich_gnu.so.gnu-46-1<br>
>> > libmpl.so.0<br>
>> > libpmi.so.0<br>
>> > libgomp.so.1<br>
>> > libquadmath.so.0<br>
>> > libmpich.so.1<br>
>> > libgcc_s.so.1<br>
>> > libportals.so.1<br>
>> > libalpsutil.so<br>
>> > libalpslli.so<br>
>> ><br>
>> ><br>
>> > _______________________________________________<br>
>> > yt-users mailing list<br>
>> > yt-users at <a href="http://lists.spacepope.org" target="_blank">lists.spacepope.org</a><br>
>> > <a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
>><br>
>><br>
><br>
</div></div><div class="HOEnZb"><div class="h5">> _______________________________________________<br>
> yt-users mailing list<br>
> <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
> <a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
><br>
_______________________________________________<br>
yt-users mailing list<br>
<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
</div></div></blockquote></div><br></div>