<div dir="ltr">Hmm, well I don't understand why pip uninstall isn't removing the old IPython files causing the conflict, but they're still hanging around.<div><br></div><div>A slightly drastic option that will definitely fix this is to completely remove your old yt installation and then install from scratch.</div>

<div><br></div><div>-Nathan</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Sep 18, 2013 at 3:19 PM, Mark Krumholz <span dir="ltr"><<a href="mailto:mkrumhol@ucsc.edu" target="_blank">mkrumhol@ucsc.edu</a>></span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div class="im"><br>
On Sep 18, 2013, at 3:04 PM, Nathan Goldbaum wrote:<br>
<br>
> Hi Mark,<br>
><br>
> Take a look at this issue: <a href="https://github.com/ipython/ipython/issues/4177" target="_blank">https://github.com/ipython/ipython/issues/4177</a><br>
><br>
> It looks like updating yt's dependencies left the old version of IPython behind.  You should be able to get rid of it by doing `pip remove IPython` and then `pip install IPython`.<br>
><br>
> That will get you IPython 1.1, which we should also add to the install script when we add jinja2.<br>
><br>
> -Nathan<br>
<br>
</div>Sorry, still no luck. I just did<br>
<br>
pip uninstall IPython<br>
pip install IPython --upgrade<br>
<br>
and I can confirm that when I start iPython I am now getting version 1.1.0:<br>
<br>
(yt-x86_64)pfe20:hmc3_mhd_lowden mkrumhol$ ipython<br>
Python 2.7.5 (default, Sep 18 2013, 13:43:29)<br>
Type "copyright", "credits" or "license" for more information.<br>
<br>
IPython 1.1.0 -- An enhanced Interactive Python.<br>
?         -> Introduction and overview of IPython's features.<br>
%quickref -> Quick reference.<br>
help      -> Python's own help system.<br>
object?   -> Details about 'object', use 'object??' for extra details.<br>
<br>
In [1]:<br>
<br>
However, when I try to run in a notebook, the error is exactly the same as before:<br>
<div class="im"><br>
yt-x86_64)pfe20:hmc3_mhd_lowden mkrumhol$ ipython notebook --no-browser --port=51707<br>
</div>2013-09-18 15:13:19.048 [NotebookApp] Using existing profile dir: u'/home3/mkrumhol/.ipython/profile_default'<br>
2013-09-18 15:13:19.126 [NotebookApp] Using MathJax from CDN: <a href="http://cdn.mathjax.org/mathjax/latest/MathJax.js" target="_blank">http://cdn.mathjax.org/mathjax/latest/MathJax.js</a><br>
2013-09-18 15:13:19.162 [NotebookApp] The port 51707 is already in use, trying another random port.<br>
2013-09-18 15:13:19.163 [NotebookApp] The port 51708 is already in use, trying another random port.<br>
2013-09-18 15:13:19.163 [NotebookApp] Serving notebooks from local directory: /nobackupp8/mkrumhol/hmc3_mhd_lowden<br>
2013-09-18 15:13:19.163 [NotebookApp] The IPython Notebook is running at: <a href="http://127.0.0.1:51709/
2013-09-18" target="_blank">http://127.0.0.1:51709/<br>
2013-09-18</a> 15:13:19.163 [NotebookApp] Use Control-C to stop this server and shut down all kernels (twice to skip confirmation).<br>
<br>
[NotebookApp] Kernel started: a97769ec-9e8b-4b2c-829a-4eca9e98644e<br>
[NotebookApp] Connecting to: tcp://<a href="http://127.0.0.1:43726" target="_blank">127.0.0.1:43726</a><br>
[NotebookApp] Connecting to: tcp://<a href="http://127.0.0.1:50412" target="_blank">127.0.0.1:50412</a><br>
[NotebookApp] Connecting to: tcp://<a href="http://127.0.0.1:55587" target="_blank">127.0.0.1:55587</a><br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5">Traceback (most recent call last):<br>
  File "<string>", line 1, in <module><br>
  File "/u/mkrumhol/yt-x86_64/lib/python2.7/site-packages/IPython/zmq/ipkernel.py", line 55, in <module><br>
    from serialize import serialize_object, unpack_apply_message<br>
  File "/u/mkrumhol/yt-x86_64/lib/python2.7/site-packages/IPython/zmq/serialize.py", line 35, in <module><br>
    from IPython.utils.pickleutil import can, uncan, canSequence, uncanSequence<br>
ImportError: cannot import name canSequence<br>
<br>
<br>
--<br>
Mark Krumholz<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
_______________________________________________<br>
yt-users mailing list<br>
<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
</div></div></blockquote></div><br></div>