Hi Latif,<br><br>You weren't doing anything stupid.  Unfortunately, the clump finder does not work in parallel.  yt is currently lacking a contour finding algorithm that works in parallel.  If anyone is interested in writing one, they would be very welcome!<br>
<br>Britton<br><br><div class="gmail_quote">On Mon, Aug 13, 2012 at 1:23 PM, Latif <span dir="ltr"><<a href="mailto:latifne@gmail.com" target="_blank">latifne@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Hi Guys, <br>I  tried to run  clump finder using the sample script available on web and just changed the minimum value of the density. Running on single cpu took too much time. So, it tried  to run it in parallel. Yt did not divide the task among cpus properly and just executed the same process on all cpus. In this way, it consumed all the memory available on the machine (128 GB ). Am i doing some thing stupid or there is a problem with yt clump finder?<br>

mpirun -np 48 ./clumpfind.py  --parallel<br>Thanks in advance!<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>Latif<br><br>
</font></span><br>_______________________________________________<br>
yt-users mailing list<br>
<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
<br></blockquote></div><br>