Hi Matt,<br><br>Thanks. That works beautifully now. <br><br>Andrew<br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jan 25, 2012 at 8:34 AM, Matthew Turk <span dir="ltr"><<a href="mailto:matthewturk@gmail.com">matthewturk@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Andrew,<br>
<br>
Okay, this looks like there was a non-standard, uncommented line in<br>
the inputs file.  (This didn't show up with the test data you passed<br>
me earlier, which isn't too surprising!)  I've pushed a new one to my<br>
repo:<br>
<br>
hg pull -r tip <a href="http://bitbucket.org/MatthewTurk/yt/" target="_blank">http://bitbucket.org/MatthewTurk/yt/</a><br>
hg up<br>
<br>
Should get it.  What this will do is simply skip over any unrecognized<br>
lines, but send an error about them.<br>
<br>
-Matt<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
On Wed, Jan 25, 2012 at 10:29 AM, Andrew Myers <<a href="mailto:atmyers@berkeley.edu">atmyers@berkeley.edu</a>> wrote:<br>
> Hi Matt,<br>
><br>
> Thanks. I'm now getting a different (and earlier) error, on the step where I<br>
> try to load the parameter file.<br>
><br>
> -Andrew<br>
><br>
><br>
> On Wed, Jan 25, 2012 at 8:19 AM, Matthew Turk <<a href="mailto:matthewturk@gmail.com">matthewturk@gmail.com</a>> wrote:<br>
>><br>
>> Hi Andrew,<br>
>><br>
>> Thanks for the bug report; how embarrassing.<br>
>><br>
>> I have pushed a fix to my repository; it only touches Orion.  Casey<br>
>> and I are fixing up some other issues in the Nyx frontend before that<br>
>> gets finished up.  I am inclined to leave Maestro and Castro and<br>
>> attempt to unify Boxlib readers rather than salve this wound.<br>
>><br>
>> This week the workshop is taking a bit of time, but early next week I<br>
>> will take a look at the (admittedly confusing) hierarchy and frontend<br>
>> code and see if I can codify this.  The changes to field detection<br>
>> resulted in this.<br>
>><br>
>> Could you please test it by doing:<br>
>><br>
>> hg pull -r 736067d72401 <a href="http://bitbucket.org/MatthewTurk/yt" target="_blank">http://bitbucket.org/MatthewTurk/yt</a><br>
>> hg up<br>
>><br>
>> and then re-running your script?<br>
>><br>
>> This also includes changes to the FLASH stuff, and I'm waiting on the<br>
>> integration tests to run before I am willing to push it to the main<br>
>> repository.  Could you let me know if it works for Orion?<br>
>><br>
>> -Matt<br>
>><br>
>> On Wed, Jan 25, 2012 at 12:01 AM, Andrew Myers <<a href="mailto:atmyers@berkeley.edu">atmyers@berkeley.edu</a>><br>
>> wrote:<br>
>> > Hello All,<br>
>> ><br>
>> > It looks like there is a problem with the current stable version of yt<br>
>> > that<br>
>> > comes up when creating a PlotCollection using Orion datasets. See the<br>
>> > script<br>
>> > here and the traceback here.<br>
>> ><br>
>> > I think the fix is that there needs to be the line<br>
>> ><br>
>> > self.field_info = pf.field_info<br>
>> ><br>
>> > somewhere in the constructor for OrionHierarchy (around line 120 of<br>
>> > yt/frontends/orion/data_structures.py). It looks like a line like this<br>
>> > used<br>
>> > to be here, but was removed during some code cleanup. If the other Orion<br>
>> > users are anything like me, they haven't updated yt in a while and thus<br>
>> > haven't noticed the problem.<br>
>> ><br>
>> > Glancing at the Nyx, Maestro, and Castro frontends, those look like they<br>
>> > might suffer from the same issue, but I don't have any of their data to<br>
>> > confirm or deny this.<br>
>> ><br>
>> > -Andrew Myers<br>
>> ><br>
>> > _______________________________________________<br>
>> > yt-users mailing list<br>
>> > <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
>> > <a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
>> ><br>
>> _______________________________________________<br>
>> yt-users mailing list<br>
>> <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
>> <a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
><br>
><br>
><br>
> _______________________________________________<br>
> yt-users mailing list<br>
> <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
> <a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
><br>
_______________________________________________<br>
yt-users mailing list<br>
<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
</div></div></blockquote></div><br>