I was trying to see if I can analyze a big simulation by using it as a big statistical sample, it was just a test of a backup plan B.<div><br></div><div>Plan A is of course analyze the big sim with many cores and lots of memory, so hopefully plan A works.</div>
<div><br></div><div>From</div><div>G.S.</div><div><br><div class="gmail_quote">On Wed, Sep 21, 2011 at 3:04 PM, Stephen Skory <span dir="ltr"><<a href="mailto:s@skory.us">s@skory.us</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
Hi Geoffrey,<br>
<div><div></div><div class="h5"><br>
> Hi Stephen, I'm trying to do halo finding in a subregion of the box, but do<br>
> the various halo finders know that the boundary conditions are no longer<br>
> periodic?  If periodic BC is on by default, is there a flag to switch off<br>
> periodicity during the subregion halo find?<br>
<br>
</div></div>I think that this question is ill-posed in the sense that I'm not sure<br>
that anything good will happen if you try halo-finding in a region<br>
that touches one of the periodic box edges. The subregion halo finding<br>
is a kludge that is primarily meant for looking at stuff only where<br>
you're interested, say in the center of your nested-grid simulation,<br>
far away from the boundaries.<br>
<br>
To answer your specific question as best I can: No, there is nothing<br>
to turn off the periodic boundaries with subregion finding. But I<br>
think you shouldn't be doing subregion finding where the boundaries<br>
are a concern. I think Bad Things (tm) will happen.<br>
<br>
Let me know if that doesn't help!<br>
<br>
--<br>
<font color="#888888">Stephen Skory<br>
<a href="mailto:s@skory.us">s@skory.us</a><br>
<a href="http://stephenskory.com/" target="_blank">http://stephenskory.com/</a><br>
<a href="tel:510.621.3687" value="+15106213687">510.621.3687</a> (google voice)<br>
_______________________________________________<br>
yt-users mailing list<br>
<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
</font></blockquote></div><br></div>