I've been seeing this behavior recently as well running with openmpi on my laptop.  Something may have crept into the halo profiler projection machinery.  I'll have a look at this.<br><br>Britton<br><br><div class="gmail_quote">
On Tue, Jan 25, 2011 at 11:05 AM, John Wise <span dir="ltr"><<a href="mailto:jwise@astro.princeton.edu">jwise@astro.princeton.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">
Hi Eric,<br>
<br>
I've seen something like this, using SGI's MPI implementation (mpt), when making projections.  Do you see all of the processors reaching the point of writing the image? If not, something's hanging one of the processors.  In my experience, I sometimes have to call MPI_Finalize() at the end of my script, e.g.,<br>

<br>
from mpi4py import MPI<br>
.<br>
.<br>
.<br>
MPI.Finalize()<br>
<br>
But I've found that you don't have to do this if you compiled mpi4py with OpenMPI or MVAPICH.  I'm not sure if this is your problem, but I wanted to throw this out there.<br>
<font color="#888888"><br>
John<br>
</font><div><div></div><div class="h5"><br>
On 25 Jan 2011, at 10:37, Eric Hallman wrote:<br>
<br>
> Hello,<br>
>  I am wondering if anyone else sees behavior like the following:<br>
><br>
> I run the halo profiler on TACC ranger, and do Hop, radial profiles and projections of all the halos. When running in the queue in parallel, everything appears to run normally, but none of the projection outputs appear in the projections directory.  If I then run in serial (interactively) the same routine, all the projections are generated as normal in the correct directory.  This happens however I do the parallel run.  Really I'm only running the parallel version for hop in any case.  I have not yet tested whether running in serial on one node of ranger gives the same issue.<br>

><br>
> I thought I would check and see if this is a known issue.<br>
><br>
> Thanks.<br>
><br>
><br>
> Eric Hallman<br>
> Google Voice: <a href="tel:+17744690278">(774) 469-0278</a><br>
> <a href="mailto:hallman13@gmail.com">hallman13@gmail.com</a><br>
><br>
><br>
><br>
><br>
> _______________________________________________<br>
> yt-users mailing list<br>
> <a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
> <a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
<br>
_______________________________________________<br>
yt-users mailing list<br>
<a href="mailto:yt-users@lists.spacepope.org">yt-users@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-users-spacepope.org</a><br>
</div></div></blockquote></div><br>