<div dir="ltr">I've opened a pull request to fix the issue you discovered with magnetic units:<div><br></div><div><a href="https://bitbucket.org/yt_analysis/yt/pull-requests/2213">https://bitbucket.org/yt_analysis/yt/pull-requests/2213</a><br></div><div><br></div><div>I'd appreciate it if one of you could give it a test. Let me know if you have questions about how to pull a pull request in locally with mercurial.</div><div><br></div><div>I haven't had a time to look at the issue you were having with the 'all' particle union, but I have it on my list to look at it.</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Fri, May 27, 2016 at 2:37 AM, Huebl, Axel <span dir="ltr"><<a href="mailto:a.huebl@hzdr.de" target="_blank">a.huebl@hzdr.de</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Dear Nathan and John,<br>
<br>
thank you for the quick answers.<br>
<br>
Yes, the resources to reproduce the questions are:<br>
<br>
Repo:<br>
  <a href="https://bitbucket.org/C0nsultant/openpmd/src?at=yt" rel="noreferrer" target="_blank">https://bitbucket.org/C0nsultant/openpmd/src?at=yt</a><br>
<br>
Example Files:<br>
  PIConGPU > 2D3V > one of the .h5 files<br>
  <a href="https://owncloud.hzdr.de/index.php/s/ouisGZe5M0wCVzj" rel="noreferrer" target="_blank">https://owncloud.hzdr.de/index.php/s/ouisGZe5M0wCVzj</a><br>
  password: openPMD<br>
<br>
Example script (attached, like last mail).<br>
<br>
<br>
Axel<br>
<span class=""><br>
On <a href="tel:24.05.2016%2018" value="+12405201618">24.05.2016 18</a>:37, Nathan Goldbaum wrote:<br>
><br>
><br>
> On Tue, May 24, 2016 at 11:30 AM, Huebl, Axel <<a href="mailto:a.huebl@hzdr.de">a.huebl@hzdr.de</a><br>
</span><div><div class="h5">> <mailto:<a href="mailto:a.huebl@hzdr.de">a.huebl@hzdr.de</a>>> wrote:<br>
><br>
>     Hi yt-devs,<br>
><br>
>     I am forwarding this conversation to the public list to keep it open for<br>
>     others to join in and to build up a record that might help others.<br>
><br>
>     Our new student Fabian updated our frontend and implemented particle<br>
>     readers. Unfortunately some details of the particle "fields" still cause<br>
>     some bumps that we can not get our head around.<br>
><br>
>     We are now able to read fields and particles, even chunk-wise, and can<br>
>     work with the data we read in python scripts via the all_data() method.<br>
><br>
>     Nevertheless, using the particle scatter plots such as yt.ParticlePlot<br>
>     seems not to work. We have some problems with unions / the "all" group<br>
>     and the fact that we have several particle species (e.g., "hot<br>
>     electrons", "cold electrons", "helium ions", "nitrogen ions", etc.)<br>
><br>
><br>
> The 'all' particle union should get set up automatically, but maybe<br>
> something is going wrong with that machinery.<br>
><br>
> Can you create a test script that illustrates this issue using a<br>
> publicly available OpenPMD dataset?<br>
><br>
><br>
><br>
>     Also since the last rebase: did someone recently change the unit system<br>
>     in yt? T for "Tesla" seems not to be understood any more. Is there a<br>
>     changelog somewhere available? Do we have to describe our data in<br>
>     cgs / mks?<br>
><br>
><br>
> I just double-checked, and Tesla should be working:<br>
><br>
> In [1]: from yt import YTQuantity<br>
><br>
> In [2]: YTQuantity(1, 'T')<br>
> Out[2]: 1.0 T<br>
><br>
> In [3]: YTQuantity(1, 'T').to_equivalent('G', 'CGS')<br>
> Out[3]: 10000.0 G<br>
><br>
> Can you explain a little bit more what issue you're having? A test<br>
> script that illustrates the issue would also help.<br>
><br>
><br>
>     Would someone be interested for a quick heads up via e.g., skype /<br>
>     web-rtc so we can ask specific questions?<br>
><br>
>     Fabian is around on Tuesdays and Fridays, something like early CA time,<br>
>     and late GER time usually works great (e.g., 9pm-PDT / 6pm-CEST).<br>
><br>
>     Our current branch HEAD can be found here (->yt->frontends->openPMD):<br>
>       <a href="https://bitbucket.org/C0nsultant/openpmd/src?at=yt" rel="noreferrer" target="_blank">https://bitbucket.org/C0nsultant/openpmd/src?at=yt</a><br>
><br>
>     And an example script is attached.<br>
><br>
><br>
>     Thanks a lot!<br>
>     Axel<br>
><br>
><br>
<br>
</div></div>--<br>
<br>
Axel Huebl<br>
Phone <a href="tel:%2B49%20351%20260%203582" value="+493512603582">+49 351 260 3582</a><br>
<a href="https://www.hzdr.de/crp" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.hzdr.de/crp</a><br>
Computational Radiation Physics<br>
Laser Particle Acceleration Division<br>
Helmholtz-Zentrum Dresden - Rossendorf e.V.<br>
<br>
Bautzner Landstrasse 400, 01328 Dresden<br>
POB 510119, D-01314 Dresden<br>
Vorstand: Prof. Dr.Dr.h.c. R. Sauerbrey<br>
          Prof. Dr.Dr.h.c. P. Joehnk<br>
VR 1693 beim Amtsgericht Dresden<br>
<br>_______________________________________________<br>
yt-dev mailing list<br>
<a href="mailto:yt-dev@lists.spacepope.org">yt-dev@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-dev-spacepope.org" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-dev-spacepope.org</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>