<br><br>On Monday, April 14, 2014, Michael Zingale <<a href="mailto:michael.zingale@stonybrook.edu">michael.zingale@stonybrook.edu</a>> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr">Recently I made the Maestro BoxLib frontend set the correct boundary periodicity for a data set, and I can confirm this when I load the data in yt and look at periodicity.  However, when I try to volume render, with no_ghost=False, I get an error in the non-periodic direction (we are periodic in x and y, and non-periodic in z).<div>

<br></div><div>The error is:</div><div><br></div><div><div>Error: bad Region in non-periodic domain: -24.0 code_length 0.0 code_length 408.0 code_length 4608.0 code_length</div><div><br></div><div>for reference, the domain size is:</div>

<div><br></div><div><div>Parameters: domain_left_edge          = [ 0.  0.  0.]</div><div>Parameters: domain_right_edge         = [ 1536.  1536.  4608.]</div></div><div><br></div><div>(aside, these should be cm, but the error reports them as code_length -- should I be setting that somwhere in the frontend?  we are always CGS).</div>

<div><br></div></div></div></blockquote><div><br></div><div>I can't speak to the volume rendering issue but this is the as-designed behavior.  This has to be code_length because other codes do not have CGS as the internal unit system and this code has to work for all frontends<span></span>, irrespective of the internal unit system. </div>
<div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div>Any thoughts on what I may be missed setting up for non-periodic BCs is appreciated.</div>
<div><br></div><div>Mike</div><div><br></div>-- <br><div>Michael Zingale</div><div>Associate Professor</div><div>
<br></div><div>Dept. of Physics & Astronomy • Stony Brook University • Stony Brook, NY 11794-3800</div><div><i>phone</i>:  631-632-8225</div><div><i>e-mail</i>: <a href="javascript:_e(%7B%7D,'cvml','Michael.Zingale@stonybrook.edu');" target="_blank">Michael.Zingale@stonybrook.edu</a></div>

<div><i>web</i>: <a href="http://www.astro.sunysb.edu/mzingale" target="_blank">http://www.astro.sunysb.edu/mzingale</a></div>
</div></div>
</blockquote>