<div dir="ltr"><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">Hi all,</span><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><br></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">I've adapted yt's gdf_writer.py into a standalone class called pygdf (<a href="https://bitbucket.org/jsoishi/pygdf" target="_blank">https://bitbucket.org/jsoishi/pygdf</a>). I've done this so that any python code can now save data in the gdf format. </div>
<div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><br></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">While doing this, I came across something in the yt gdf frontend that I'm not quite sure I understand. In the grid metadata, yt expects /grid_particle_count to be a 2-D array, but the gdf standard clearly states this should be a 1-D (int64, N) array, where N is the number of grids. Further complicating the issue is the fact that if I create a 1-D array for /grid_particle_count, the failure point in the following script</div>
<div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><br></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">from yt.mods import *</div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">pf = load("/tmp/blah.gdf")</div>
<div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><br></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">sp = SlicePlot(pf, 2, "Density")</div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">
<br></div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">is actually in data_objects/grid_patch.py, not in the gdf frontend itself. The file /tmp/blah.gdf can be generated by running the test.py script in pygdf.</span><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">
<br></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">The obvious workaround is to simply make /grid_particle_count a 2D array (this is especially so since I'm not actually using particles at the moment), but I'm not sure why this should be so. The total count of particles in N grids seems to be better fit in a 1-D array to me. However, I'd like to understand better what's going on. Any pointers or clarification would be very helpful.</div>
<div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><br></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">Also, any feedback on pygdf would be most welcome!</div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">
<br></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">thanks,</div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><br></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">j</div></div>