<div dir="ltr">No problem - didn't take long to fix it. Sounds good.</div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Wed, May 29, 2013 at 2:51 PM, Matthew Turk <span dir="ltr"><<a href="mailto:matthewturk@gmail.com" target="_blank">matthewturk@gmail.com</a>></span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">I'm going to pull it in ASAP, and I'll close it when I do.  Sorry<br>
about the trouble.  I'll do another big merge after 3.0a2 comes out.<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
On Wed, May 29, 2013 at 5:48 PM, Casey W. Stark <<a href="mailto:caseywstark@gmail.com">caseywstark@gmail.com</a>> wrote:<br>
> Should I close the issue or leave it open until this is pulled into 3.0?<br>
><br>
><br>
> On Wed, May 29, 2013 at 2:39 PM, Nathan Goldbaum <<a href="mailto:nathan12343@gmail.com">nathan12343@gmail.com</a>><br>
> wrote:<br>
>><br>
>> I left a comment on the bitbucket issue - the bug is fixed in 2.X but not<br>
>> fixed in 3.0.<br>
>><br>
>> On May 29, 2013, at 2:36 PM, Anthony Scopatz <<a href="mailto:scopatz@gmail.com">scopatz@gmail.com</a>> wrote:<br>
>><br>
>> Hello All,<br>
>><br>
>> I have seen this issue before, but I forget what fixed it.  What version<br>
>> of Python are you using?  Module shared objects get different names in<br>
>> Python 3.  This file would be called something like <a href="http://fKDpy.cpython.so" target="_blank">fKDpy.cpython.so</a><br>
>> instead, which is why setup.py would not find it.  Try a clean rebuild using<br>
>> Python 2.<br>
>><br>
>> Be Well<br>
>> Anthony<br>
>><br>
>><br>
>> On Wed, May 29, 2013 at 4:25 PM, Casey Stark <<a href="mailto:issues-reply@bitbucket.org">issues-reply@bitbucket.org</a>><br>
>> wrote:<br>
>>><br>
>>> New issue 581: Source install error from fKDpy<br>
>>><br>
>>> <a href="https://bitbucket.org/yt_analysis/yt/issue/581/source-install-error-from-fkdpy" target="_blank">https://bitbucket.org/yt_analysis/yt/issue/581/source-install-error-from-fkdpy</a><br>
>>><br>
>>> Casey Stark:<br>
>>><br>
>>> I'm installing yt-3.0 on NERSC's hopper following the instructions on<br>
>>> <a href="http://www.nersc.gov/users/software/development-tools/python-tools/" target="_blank">http://www.nersc.gov/users/software/development-tools/python-tools/</a>. The<br>
>>> install fails because the setup script first decides not to build fKDpy.so,<br>
>>> but then later tries to copy it to the build directory. Here are the pieces<br>
>>> of the log:<br>
>>><br>
>>> ```<br>
>>> $ python setup.py install --home=~/python_modules/hopper<br>
>>> PNG_LOCATION: png found in: /usr/include, /usr/lib<br>
>>> FTYPE_LOCATION: freetype found in: /usr/include, /usr/lib<br>
>>> HDF5_LOCATION: HDF5_DIR: /opt/cray/hdf5/1.8.8/gnu/47/include,<br>
>>> /opt/cray/hdf5/1.8.8/gnu/47/lib<br>
>>> running install<br>
>>> running bdist_egg<br>
>>> running egg_info<br>
>>> running build_src<br>
>>> running build_forthon<br>
>>> fKDpy.so won't be built due to missing Forthon/gfortran<br>
>>> build_src<br>
>>> ...<br>
>>> running install_data<br>
>>> error: can't copy 'yt/utilities/kdtree/fKDpy.so': doesn't exist or not a<br>
>>> regular file<br>
>>> ```<br>
>>><br>
>>> Am I missing something here?<br>
>>><br>
>>><br>
>>> _______________________________________________<br>
>>> yt-dev mailing list<br>
>>> <a href="mailto:yt-dev@lists.spacepope.org">yt-dev@lists.spacepope.org</a><br>
>>> <a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-dev-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-dev-spacepope.org</a><br>
>><br>
>><br>
>> _______________________________________________<br>
>> yt-dev mailing list<br>
>> <a href="mailto:yt-dev@lists.spacepope.org">yt-dev@lists.spacepope.org</a><br>
>> <a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-dev-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-dev-spacepope.org</a><br>
>><br>
>><br>
>><br>
>> _______________________________________________<br>
>> yt-dev mailing list<br>
>> <a href="mailto:yt-dev@lists.spacepope.org">yt-dev@lists.spacepope.org</a><br>
>> <a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-dev-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-dev-spacepope.org</a><br>
>><br>
><br>
><br>
> _______________________________________________<br>
> yt-dev mailing list<br>
> <a href="mailto:yt-dev@lists.spacepope.org">yt-dev@lists.spacepope.org</a><br>
> <a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-dev-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-dev-spacepope.org</a><br>
><br>
_______________________________________________<br>
yt-dev mailing list<br>
<a href="mailto:yt-dev@lists.spacepope.org">yt-dev@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-dev-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-dev-spacepope.org</a><br>
</div></div></blockquote></div><br></div>