I'll try it over the weekend, have a DD from a 256 cube on my macbook air.<div><br></div><div>Is there anything I need to do i.e. pull from a specific repo like last time, or using the dev install script would automatically give me the changes you've put in for the optional tree="C" ability?</div>
<div><br></div><div>I think all I need is to run parallelHF several times in one script.  If there is indeed leak in the Fortran kdtree, I should be able to run it on the same dataset multiple of times within the same python instance and see the memory increase.<br>
<br></div><div>From</div><div>G.S.</div><div><br><div class="gmail_quote">On Fri, Nov 18, 2011 at 1:04 PM, Stephen Skory <span dir="ltr"><<a href="mailto:s@skory.us">s@skory.us</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
Hi all,<br>
<div class="im"><br>
> Attached is the memory output plotted of parallelHF with 256 cores, so every<br>
> 256 (in the x axis) it looks like a step function.<br>
<br>
</div>That is an unfortunate graph!<br>
<div class="im"><br>
> These issues were found before the new optional KDtree was put in by<br>
> Stephen, so that is definitely something we can try.<br>
<br>
</div>If you do decide to test out the alternative kD tree for memory<br>
conservation, I would suggest trying a much smaller dataset to begin<br>
with. It is much slower than the Fortran one. I am very curious to<br>
find out what you discover!<br>
<div class="im"><br>
--<br>
Stephen Skory<br>
<a href="mailto:s@skory.us">s@skory.us</a><br>
<a href="http://stephenskory.com/" target="_blank">http://stephenskory.com/</a><br>
<a href="tel:510.621.3687" value="+15106213687">510.621.3687</a> (google voice)<br>
</div><div><div></div><div class="h5">_______________________________________________<br>
yt-dev mailing list<br>
<a href="mailto:yt-dev@lists.spacepope.org">yt-dev@lists.spacepope.org</a><br>
<a href="http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-dev-spacepope.org" target="_blank">http://lists.spacepope.org/listinfo.cgi/yt-dev-spacepope.org</a><br>
</div></div></blockquote></div><br></div>